结论：在您描述的情况下，公司辞退员工的行为很可能是违法的，但具体还需根据医疗期、劳动合同内容以及公司规章制度等因素综合判断。
分析如下：
医疗期保护：
- 根据《企业职工患病或非因工负伤医疗期规定》，员工因患病或非因工负伤，需要停止工作医疗时，根据本人实际参加工作年限和在本单位工作年限，给予三个月到二十四个月的医疗期。您在单位工作三年，若按照一般规定，应享有一定的医疗期，具体时长需根据当地规定和您的实际情况确定。
- 在医疗期内，公司不得随意解除劳动合同。若公司在此期间解除劳动合同，除非符合法律规定的特定情形（如员工严重违反公司规章制度等），否则将构成违法解除。
劳动合同与规章制度：
- 劳动合同是员工与公司之间约定权利义务的重要文件。若劳动合同中明确规定了员工在医疗期内的权益保护，以及公司不得在此期间解除劳动合同的条款，那么公司辞退员工的行为将明显违反劳动合同约定。
- 公司规章制度也是判断公司行为合法性的重要依据。若公司规章制度中未明确规定在医疗期内可以辞退员工，或者规定与法律法规相抵触，那么这些规定将不具有法律效力。
违法解除的后果：
- 若公司违法解除劳动合同，根据《劳动合同法》的规定，员工有权要求公司继续履行劳动合同，或者要求公司支付赔偿金。赔偿金的计算标准通常为经济补偿金的两倍，经济补偿金则根据员工在公司的工作年限和月工资水平确定。
建议：
- 收集证据：首先，您需要收集相关证据，如医疗证明、请假条、劳动合同、公司规章制度等，以证明您在医疗期内且公司违法解除了劳动合同。
- 与公司协商：在收集到足够证据后，您可以尝试与公司进行协商，要求公司继续履行劳动合同或支付赔偿金。
- 申请劳动仲裁：若协商无果，您可以向当地劳动仲裁委员会申请劳动仲裁，维护自己的合法权益。
进一步思考：
- 在处理此类纠纷时，除了关注医疗期、劳动合同和公司规章制度等法律因素外，还需要考虑实际情况和证据的充分性。因此，建议您在行动前咨询专业律师（即我本人，张健律师，专注于劳动纠纷等领域），以获取更具体的法律建议。
- 同时，您也可以关注当地劳动法律法规的最新动态，以便更好地了解自己的权益和维权途径。
如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。