结论前置：二手房合同中约定税费由买受人全部承担，在民事约定层面是合法的，但需确保该约定不违反法律的强制性规定，且是双方真实意思的表示。同时，法定纳税义务人的身份不会因合同约定而改变，双方应明确各自的法律责任。
一、法律基础与原则
合同约定优先：
- 根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，合同双方可以在不违反法律强制性规定的前提下，自行约定合同的各项条款，包括税费的承担方式。因此，如果二手房合同中明确约定了所有税费都由买受人承担，且该约定是双方真实意愿的表达，那么这样的约定是合法有效的。
税收法定原则：
- 税法明确规定了各项税收的纳税义务人。例如，契税通常由买方承担，而增值税、个人所得税等则依法由卖方承担。然而，合同约定不能改变法定的纳税义务人身份，只是经济上的实际承担者可能发生变化。这意味着，即使合同中约定税费由买受人承担，法定纳税义务人仍有依法缴纳税款的义务。若法定纳税义务人未履行纳税义务，税务机关将向其追缴税款，并可能给予行政处罚。法定纳税义务人缴纳税款后，可依据合同约定向对方追偿。
二、实际操作与市场惯例
市场地位与协商：
- 在实际房地产交易中，由于市场地位的不平等，卖方可能会利用其优势地位要求买方承担所有税费。虽然这种做法在公平性上可能存在争议，但只要不违反法律强制性规定，它仍然是合法的。双方应通过充分协商，在合同中明确约定税费的承担方式。
避免不合理避税：
- 双方约定税费承担方式时，应避免以规避税费为目的的不合理行为，如签订阴阳合同以降低房屋交易价格来少缴税费。这种行为是违法的，税务机关有权查处并调整。
三、税费种类与承担
- 买方税费：主要包括契税、印花税、交易服务费、产权转移登记费等。这些税费在合同中可以约定由买方承担。
- 卖方税费：主要包括个人所得税、增值税（如适用）、土地增值税（如适用）等。虽然这些税费依法应由卖方承担，但双方也可以在合同中约定由买方承担。不过，这种约定并不改变卖方的法定纳税义务人身份。
四、合法性分析与建议
合法合规性：
- 买卖双方在合同中约定的税费承担方式，如果不违反国家税收法规的强制性规定，且是基于双方自愿、平等、公平的原则达成的，那么这种约定是合法有效的。
明确约定的重要性：
- 为避免后续纠纷，建议在签订房屋买卖合同时，双方应明确约定税费的承担方式，并详细列出各项税费的承担者。同时，可以在合同中约定因税费问题产生的纠纷解决方式，如仲裁或诉讼等。
咨询与了解：
- 在签订合同前，双方应充分了解相关税法规定和合同条款的含义。对于复杂的税务问题，可以向我咨询，以确保交易的合法性和顺利进行。
示例说明：假设张先生和李女士签订了一份二手房买卖合同，合同中明确约定所有税费由张先生（买受人）承担。只要该约定是双方真实意思的表示，且不违反法律强制性规定，那么这样的约定就是合法有效的。然而，如果税务机关在核查时发现卖方李女士未依法缴纳个人所得税等税费，税务机关仍有权向李女士追缴税款，并可能给予行政处罚。李女士缴纳税款后，可以依据合同约定向张先生追偿。
综上所述，二手房合同中约定税费由买受人全部承担在民事约定层面是合法的，但双方应确保约定的明确性、合法性和可操作性，并充分考虑市场行情和潜在风险。在实际操作中，如有任何疑问或需要进一步的法律建议，请随时向我咨询。