合同中约定税费承担条款是有效的。这一结论基于民法自治原则以及“有约从约”的原则。具体来说，虽然我国税收管理方面的法律法规明确规定了各种税收的纳税义务人，但并未禁止纳税义务人外的其他人代为缴纳税款。税法对于税种、税率、税额的规定是强制性的，但对于实际由谁缴纳税款，并没有作出强制性或禁止性规定。

详细解释如下：

1. 税费承担与纳税义务的区别：

   • 纳税义务：是法定的，包括向税务机关支付税费、办理纳税登记、纳税申报等。纳税义务不能通过合同约定进行转移，否则将无效。
   • 税费承担：指的是合同中约定的由哪一方实际承担税费支付的责任。这一约定在合同各方之间有效，且不影响税务机关认定的缴税主体和纳税责任。

2. 法律依据：

   • 根据《民法典》及相关税收法律法规，税费承担的约定并未违反法律的强制性规定，因此是有效的。
   • 最高院的判例也支持了这一点，例如在司法拍卖中，拍卖公告中明确说明办理过户手续所产生的一切费用（包括税费）由买受人承担，这样的约定被认定为有效。

3. 实践中的应用：

   • 在房屋交易、商品买卖等合同中，常见税费承担条款，如“交易中所有的税费问题由买方承担”。这样的约定在合同双方之间具有法律效力，买方需按照约定承担税费。
   • 如果合同中对税费承担约定不明或存在争议，双方应协商解决；协商不成的，可诉诸法律途径解决。

4. 注意事项：

   • 税费承担的约定应明确、具体，避免模糊不清导致争议。
   • 合同双方应充分了解税费承担的法律后果，确保约定符合自身意愿和实际情况。

综上所述，合同中约定税费承担条款是有效的，但需要注意的是，这一约定并不影响税务机关认定的缴税主体和纳税责任。在实际操作中，合同双方应明确约定税费承担的具体内容和方式，以避免不必要的争议和纠纷。