合同中约定税费由对方承担，在一定条件下是合法的，但具体是否有效需根据双方的真实意思表示、合同内容以及相关法律法规进行综合判断。以下是对此问题的详细分析：
一、合法性基础
意思自治原则：
- 合同是双方当事人意思表示一致的产物，只要不违反法律法规的强制性规定、不损害国家利益、社会公共利益以及第三人合法权益，当事人可以自行约定合同的各项条款，包括税费的承担方式。这是合同法的基本原则之一，体现了对当事人意思自治的尊重。
税法与合同法的协调：
- 税法规定了纳税义务人的法定性，但并未禁止合同双方通过约定来改变税款的实际承担方式。只要合同约定不违反税法的具体规定，如不构成逃税或避税行为，该约定即具有法律效力。
二、具体分析
有效约定：
- 在房屋买卖、租赁、股权转让等合同中，双方可以约定由一方承担全部或部分税费。例如，在房屋买卖合同中，买卖双方可以约定由买方承担所有税费，包括契税、个人所得税等。此类约定在双方真实意思表示且不违反法律强制性规定的情况下，通常是有效的。
- 约定税费承担时，应明确该条款的效力及可能存在的法律风险，以确保合同的合法性和有效性。例如，可以在合同中明确约定：“本合同项下的所有税费，包括但不限于契税、个人所得税等，均由买方承担。”
无效或可撤销约定：
- 如果约定的税款承担违反了法律法规的强制性规定，特别是税收法律法规中明确规定某些税款应由特定主体承担的情况，那么该约定将无效或被撤销。例如，企业所得税的纳税义务人是企业本身，不能通过合同约定转移给他人承担。
- 如果约定的税款承担构成逃税或避税行为，触犯税法的相关规定，同样会被视为无效。逃税或避税行为不仅会导致合同条款无效，还可能面临税务机关的行政处罚甚至刑事责任。
纳税义务人的法定性：
- 税法明确规定了各项税收的纳税义务人，即使合同约定税费由对方承担，法定纳税义务人仍有依法缴纳税款的义务。这是税法的强制性规定，不能通过合同约定来改变。
- 如法定纳税义务人未履行纳税义务，税务机关将向其追缴税款、加收滞纳金并可能给予行政处罚。法定纳税义务人缴纳税款后，可依据合同约定向对方追偿。
三、注意事项与建议
明确纳税义务：
- 在商业交易中，双方应明确各自的纳税义务，并依法缴纳税款。这是避免税务纠纷的基础。
详细合同条款：
- 在合同中约定税费承担时，应使用清晰、明确的语言描述，并注明该条款的效力及可能存在的法律风险。例如，可以明确约定税费的种类、金额、支付时间、支付方式等。
关注税收政策变化：
- 税收政策可能随时间发生变化，当事人在签订合同时应关注相关政策动态，并在合同中约定相应的调整机制或处理方式。例如，可以约定如果税率调整，双方应按照新的税率重新计算税费并承担相应责任。
保留相关证据：
- 在履行合同过程中，双方应保留好与税费承担相关的证据，如发票、付款凭证等。这些证据在发生纠纷时将起到关键作用。
举例说明：假设在一份房屋买卖合同中，买卖双方约定由买方承担所有税费。如果合同内容合法、双方真实意思表示一致，且不违反税法的具体规定，那么该约定是有效的。但如果合同中约定由买方承担企业所得税，由于企业所得税的纳税义务人是企业本身，不能通过合同约定转移给他人承担，因此该约定将无效。
总结来说，合同中约定税费由对方承担在一定条件下是合法的，但具体是否有效需根据双方的真实意思表示、合同内容以及相关法律法规进行综合判断。为确保合同的合法性和有效性，建议在签订前仔细审查合同条款并咨询专业意见（当然，这里你可以直接向我咨询，我会为你提供专业的法律建议）。