购买二手厂房时，双方签订合同约定所有税费由买方承担，这样的条款在法律上是有效的，但需满足一定条件。以下从多个角度进行分析：
法律有效性角度
合同自由原则：根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，民事主体从事民事活动，应当遵循自愿原则，按照自己的意思设立、变更、终止民事法律关系。在房屋买卖合同中，双方有权自由约定税费的承担方式，只要该约定不违反法律、行政法规的强制性规定，不违背公序良俗，就是有效的。
税费承担约定的合法性：税费承担条款本身并不违反法律的强制性规定。在房屋买卖交易中，税费是交易成本的一部分，双方可以通过协商确定由哪一方承担。因此，约定所有税费由买方承担，并不构成违法或无效的情形。
实际操作与风险角度
明确税费种类与金额：虽然税费承担条款在法律上是有效的，但在实际操作中，双方应明确约定具体承担的税费种类和金额。由于税费政策可能随时间变化，且不同地区的税费标准也可能存在差异，因此，在签订合同时，应尽可能详细地列明各项税费，以避免后续争议。
买方风险：对于买方而言，承担所有税费可能增加其交易成本。如果税费金额较大，买方应在签订合同前充分评估自身经济能力，确保能够承担这些额外费用。同时，买方也应关注税费政策的变化，以免因政策调整导致税费增加而带来不必要的经济损失。
卖方责任：虽然税费由买方承担，但卖方仍有义务配合买方办理相关税费缴纳手续，并提供必要的证明文件和资料。如果卖方拒绝配合或提供虚假信息，导致买方无法顺利缴纳税费或产生额外费用，卖方应承担相应的法律责任。
合同条款表述与履行角度
条款表述清晰：在签订合同时，双方应确保税费承担条款的表述清晰、明确，避免使用模糊或歧义的表述方式。例如，可以明确约定“本合同项下的所有税费（包括但不限于契税、增值税、个人所得税等）均由买方承担”。
履行过程中的沟通：在合同履行过程中，双方应保持沟通，及时就税费缴纳事宜进行协商和确认。如果因税费政策变化或其他原因导致税费金额发生变化，双方应及时调整合同条款或签订补充协议，以确保合同的顺利履行。
总结与建议：购买二手厂房时，双方签订合同约定所有税费由买方承担是有效的，但需注意明确税费种类与金额、评估买方经济能力、确保卖方配合义务以及条款表述清晰等问题。如果你在签订或履行此类合同时遇到任何疑问或问题，可以直接向我咨询，我会为你提供专业的法律意见和帮助。