公司员工手册规定员工节假日多放的假期优先抵扣年假，这一规定的合法性取决于是否事先与员工达成协议，并征得员工的同意，以及是否遵守了相关法律法规。以下是对这一问题的详细分析：

1. 合法情况分析：

   • 员工同意与自主处分：如果公司提前与员工进行了充分的沟通协商，并且员工明确同意用公司统一放假的时间来抵扣年假，那么这种规定是合法的。因为年假虽为法定权利，但员工有权自主处分其休假权利，同意抵扣即视为对自身权利的合法处分。
   • 规章制度的有效性：若公司有明确的规章制度，规定在特定情况下公司放假可以抵扣年假，且该规章制度在制定时经过了民主程序讨论，并向员工公示，那么这种规定可能被认定为有效。在此情况下，依据规章制度进行的抵扣也是合法的。
   • 法律依据：根据《职工带薪年休假条例》第五条，单位根据生产、工作的具体情况，并考虑职工本人意愿，统筹安排职工年休假。这意味着，在尊重员工意愿的前提下，单位有权安排年休假，包括可能的抵扣安排。

2. 不合法情况分析：

   • 未经员工同意：公司未经员工同意，擅自将放假时间抵扣年假，这侵犯了员工自主安排年假的权利，是不合法的。年假是员工的法定假期，员工有权在合适的时间按照自己的意愿申请和安排休假。
   • 规章制度不合法：如果公司的规章制度在制定时没有经过民主程序讨论，或未向员工公示，那么即使其中有关于放假抵扣年假的规定，该规定也是无效的。以这样的规定来抵扣年假，同样是不合法的。
   • 法定节假日不可抵扣：法定节假日是全体员工统一放假的日子，这些天数不能用于抵扣员工的年假。如果公司试图将法定节假日计入抵扣范围，也是违法的。

3. 员工权益保护与救济途径：

   • 如果员工认为公司放假抵扣年假的行为侵犯了自己的合法权益，首先应与公司进行沟通协商，要求公司纠正错误做法。
   • 若协商不成，员工可以向劳动监察部门投诉，要求维护自己的合法权益。
   • 员工还可以选择申请劳动争议仲裁，通过法律途径来维护自己的年假权益。

建议：

• 对于公司而言，在制定员工手册或相关规章制度时，应确保经过民主程序讨论，并向员工公示，以确保规章制度的合法性。同时，在涉及员工年假等权益问题时，应充分尊重员工的意愿，与员工进行充分沟通协商。
• 对于员工而言，应了解自己的年假权益，并在公司试图侵犯这些权益时，及时与公司沟通协商或寻求法律救济。

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