结论：是否扣你姐姐的工资，不能一概而论，需要结合你们之间的具体约定、你姐姐缺勤的原因以及相关法律法规来综合判断。以下从几个不同角度为你详细分析：

从双方约定角度

如果你们之间事先有明确的约定，比如约定了工作期间必须全勤，缺勤就要扣除相应工资，那么在这种情况下，从契约精神的角度出发，你按照约定扣除她六天的工资是合理的。但这种约定应当是双方自愿、平等协商达成的，不能存在一方强迫另一方接受不公平条款的情况。例如，你们在开始合作时就明确说好，一个月工作30天，工资按30天计算，缺一天就扣一天的工资，并且你姐姐当时也同意了，那么你扣工资就有约定依据。

从缺勤原因角度

1. 合理缺勤：如果你姐姐缺勤是因为一些合理且不可抗拒的原因，比如突发疾病需要住院治疗、遭遇重大意外事故等，这种情况下扣除她的工资可能不太合适。从人道主义和亲情的角度考虑，她本身已经因为这些突发情况遭受了损失和痛苦，再扣除工资会加重她的负担。而且，法律上也倡导用人单位（在这里可以类比为你作为雇主的角色）对员工（你姐姐）的合理缺勤给予一定的理解和宽容。
2. 无故缺勤：要是你姐姐没有合理的理由就擅自缺勤六天，这属于违反工作纪律的行为。在这种情况下，你扣除她工资有一定的合理性，但扣除的金额也需要合理。不能随意大幅度扣除，一般扣除的工资数额不应超过她缺勤期间应得工资的合理范围。比如，她一天的工资是200元，那么扣除六天的工资1200元是比较合理的；但如果你要扣除她一个月工资的大部分甚至全部，这就可能不合理了。

从法律法规角度

虽然你们之间是亲属关系，但如果在工作过程中形成了事实上的劳动关系，那么就受到劳动法律法规的约束。根据《工资支付暂行规定》等相关法律法规，用人单位（你）不得随意克扣劳动者（你姐姐）的工资。因劳动者本人原因给用人单位造成经济损失的，用人单位可按照劳动合同的约定要求其赔偿经济损失。经济损失的赔偿，可从劳动者本人的工资中扣除，但每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20%。若扣除后的剩余工资部分低于当地月最低工资标准，则按最低工资标准支付。不过，你们这种情况是否适用该规定还需要看是否构成劳动关系以及具体的情况。如果只是简单的亲属间帮忙，没有形成劳动关系，那么主要依据双方的约定和道德、亲情等因素来判断。

建议：你可以先和你姐姐进行坦诚的沟通，了解她缺勤的具体原因。如果是因为合理原因，可以考虑不扣除工资或者适当给予一些帮助；如果是无故缺勤，可以和她协商扣除合理的工资数额，避免因为工资问题影响你们之间的亲情关系。如果你们对是否扣工资以及扣多少存在争议，也可以寻求第三方调解，比如找家族中比较有威望的长辈来帮忙协调解决。

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