若骨折工伤请假三个月后仍未康复，可按以下步骤处理：

1. 及时申请延长停工留薪期
   根据《工伤保险条例》第三十三条，停工留薪期一般不超过12个月，但需经劳动能力鉴定委员会确认。若三个月未康复，应立即向单位提交书面申请，附上医院出具的《诊断证明书》《病假建议书》等材料，说明仍需治疗的具体原因（如骨折愈合延迟、并发症等）。单位需在15日内向社保部门提出延长申请，逾期未申请的，可自行向劳动能力鉴定委员会申请确认。

2. 进行劳动能力鉴定
   若停工留薪期满后仍需治疗，可申请劳动能力鉴定（伤残等级评定）。根据鉴定结果：

   • 若构成伤残：根据《工伤保险条例》第三十四条至三十六条，可享受一次性伤残补助金、伤残津贴（一至四级）或一次性工伤医疗补助金、一次性伤残就业补助金（五至十级）。
     
   • 若未构成伤残：单位需按原工资福利支付停工留薪期工资（最长12个月），期满后若仍不能工作，单位可按《企业职工患病或非因工负伤医疗期规定》给予医疗期（一般3-24个月，根据工龄确定），医疗期内按不低于当地最低工资80%支付病假工资。

3. 保留证据，防范纠纷

   • 保存所有医疗记录（病历、检查报告、用药清单等）、病假证明、与单位沟通的书面记录（邮件、微信等）。
     
   • 若单位拒绝延长停工留薪期或停发病假工资，可向当地劳动监察大队投诉，或申请劳动仲裁，主张继续享受工伤待遇或医疗期待遇。

4. 特殊情况处理

   • 旧伤复发：若康复后因工作原因旧伤复发，需重新申请停工留薪期，并提交医院证明。
     
   • 单位违法解除合同：若单位在医疗期内解除劳动合同，属违法解除，可主张2N赔偿金（N为工作年限）或要求继续履行合同。

行动建议：立即联系主治医生出具详细病情说明，向单位提交延长停工留薪期申请，并同步准备劳动能力鉴定材料。若遇单位推诿，可携带证据向我咨询具体维权方案。