结论：员工人事关系已不在公司时，终止合同的方式主要取决于合同的具体状态、双方协商情况以及相关法律法规的规定。以下是从不同角度对这一问题的详细分析：

1. 合同到期自然终止：

   • 如果劳动合同已经到期，且双方没有续签的意愿或行为，那么合同将自然终止。此时，公司无需采取额外措施来终止合同，但应确保按照法律法规的规定，为员工办理离职手续，如结算工资、转移社保等。

2. 双方协商一致终止：

   • 无论合同是否到期，只要双方协商一致，都可以提前终止劳动合同。在这种情况下，公司应与员工签订书面协议，明确终止合同的时间、条件以及双方的权利和义务。这有助于避免未来可能出现的纠纷。

3. 员工主动离职：

   • 如果员工主动提出离职，并且已经按照公司规定办理了离职手续，那么合同将在员工离职之日终止。公司应确保员工离职手续的合法性和完整性，包括但不限于工作交接、工资结算、社保转移等。

4. 公司依法解除劳动合同：

   • 如果员工存在严重违反公司规章制度、严重失职或营私舞弊给公司造成重大损害等情形，公司可以依法解除劳动合同。在这种情况下，公司应确保解除合同的程序合法，如提前通知员工、听取员工意见、出具解除合同通知书等。同时，公司还应按照法律法规的规定，为员工办理离职手续并支付相应的经济补偿（如适用）。

5. 特殊情况下的合同终止：

   • 如果员工因病或非因工负伤，在规定的医疗期满后不能从事原工作，也不能从事由公司另行安排的工作的，或者员工不能胜任工作，经过培训或者调整工作岗位，仍不能胜任工作的，公司可以提前三十日以书面形式通知员工本人或者额外支付员工一个月工资后，解除劳动合同。此外，如果公司因客观情况发生重大变化，致使劳动合同无法履行，且双方未能就变更劳动合同内容达成协议的，公司也可以依法解除劳动合同。

法律建议：

• 在终止合同前，公司应仔细审查劳动合同及相关法律法规，确保终止合同的合法性和合规性。
• 公司应与员工进行充分沟通，了解员工的意愿和需求，尽量通过协商一致的方式终止合同，以减少纠纷和冲突。
• 如果公司需要依法解除劳动合同，应确保解除程序的合法性和完整性，包括提前通知、听取意见、出具通知书等步骤。
• 在终止合同后，公司应按照法律法规的规定为员工办理离职手续，并支付相应的经济补偿（如适用）。

可能法律后果：

• 如果公司违反法律法规或劳动合同的规定终止合同，可能会面临劳动仲裁或诉讼的风险，需要承担相应的法律责任和经济赔偿。
• 如果员工对终止合同有异议，可能会向劳动仲裁机构或法院提起仲裁或诉讼，要求公司继续履行合同或支付赔偿金等。

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