针对您提出的问题，即“不同的两个公司货车是同一人签的挂靠合同发生事故保险公司赔付吗”，以下是我为您提供的详细解答：
首先，我们需要明确的是，两个货车虽然挂靠在不同的公司，但如果是同一人签订的挂靠合同，这并不影响保险公司根据保险条款进行赔付的基本原则。保险公司赔付的关键在于保险合同的具体约定以及事故发生的具体情况。
一、交强险赔付情况
交强险是法定强制保险，只要车辆投保了交强险，并在交通事故中导致第三方人身伤亡或财产损失且负有事故责任，交强险承保公司就会在交强险责任限额范围内进行赔付。这一赔付原则与车辆是否挂靠同一公司或不同公司无关。赔付限额分为有责和无责两种情况，具体限额标准如我之前所述。
二、商业险赔付情况
商业险的赔付则取决于保险合同的约定和投保情况。
如果商业险是以挂靠公司名义投保：且事故车辆在保险合同约定的承保范围内，那么保险公司会按照商业险合同约定进行赔付。这里的关键是确认事故车辆是否属于保险合同的承保范围。
如果实际车主以自己名义投保商业险：且事故属于保险责任范围，那么保险公司同样会依据保险合同向被保险人（即实际车主）承担赔付责任。在这种情况下，挂靠公司的身份并不影响保险公司的赔付决定。
三、挂靠公司管理责任的影响
挂靠公司在车辆运营中的管理责任也会影响其是否需要承担赔偿责任。如果挂靠公司对车辆运营存在管理上的过错，如未进行必要的安全检查、对驾驶员资质审核把关不严等，导致事故发生，那么挂靠公司可能要对事故受害人承担相应的赔偿责任。此外，如果挂靠合同中约定了挂靠公司在某些特定情况下需对事故损失负责，那么挂靠公司还需按照合同约定执行。
四、特殊情况下保险公司的免责
需要注意的是，存在以下情形之一时，保险公司不承担赔偿责任：驾驶人未取得驾驶资格或者醉酒的；被保险机动车被盗抢期间肇事的；被保险人故意制造道路交通事故的。这些情形是保险公司免责的法定条件，与车辆挂靠情况无关。
五、具体赔付情况的判定
如果两辆挂靠货车发生相互碰撞：且双方都有责任时，保险会按照责任比例进行赔付。交强险先在限额内赔偿对方损失，超出部分由商业险根据责任划分赔偿。
如果挂靠货车与第三方发生事故：根据事故责任认定，交强险和商业险会对第三方损失进行赔付。如果两辆车都有责任，保险赔偿将按责任比例分担第三方的损失。
综上所述，两个货车挂靠在不同公司但由同一人签订挂靠合同发生事故后，保险公司的赔付情况需综合考虑交强险、商业险的条款约定以及挂靠公司的管理责任。在具体实践中，应通过法律程序来确定各方的责任范围和赔偿金额。如果您对此有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时咨询专业律师或保险公司。