结论：房产营销公司拿您的房款抵开发商佣金这一行为是否合法，需根据具体情况判断，若未经您同意擅自操作，则不合法；若经您同意且符合合同约定，则可能合法。以下从不同角度为您详细分析：
一、未经您同意擅自操作的情况
法律背景：
- 根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，合同双方应当遵循诚实信用原则，按照约定履行自己的义务。房产营销公司作为中介方，其职责是促成房屋买卖合同的成立，并收取相应的中介费用。
- 房款是购房者支付给开发商的购房款项，属于购房者的财产。房产营销公司无权擅自处分购房者的房款，包括将其用于抵偿开发商的佣金。
法律后果：
- 如果房产营销公司未经您同意，擅自将您的房款用于抵偿开发商的佣金，这构成了对您的财产权的侵犯。您有权要求房产营销公司返还房款，并可能要求其承担违约责任或赔偿责任。
- 同时，您也可以向相关部门投诉或举报房产营销公司的违法行为，以维护自己的合法权益。
二、经您同意且符合合同约定的情况
法律背景：
- 如果您在签订房屋买卖合同或相关协议时，明确同意房产营销公司可以将部分房款用于抵偿开发商的佣金，并且这一约定不违反法律法规的强制性规定，那么这种行为可能是合法的。
- 在这种情况下，房产营销公司的行为是基于您的授权和合同约定进行的，不构成对您的财产权的侵犯。
注意事项：
- 即使您同意房产营销公司将房款用于抵偿佣金，也应确保这一约定明确、具体，并写入合同或相关协议中。
- 您应仔细阅读合同条款，了解自己的权利和义务，避免在不知情的情况下承担不必要的风险。
- 如果合同中存在模糊或不明确的地方，您应及时与房产营销公司沟通并协商修改，以确保自己的权益得到保障。
三、其他可能的情况
开发商与房产营销公司的内部协议：
- 有时候，开发商与房产营销公司之间可能存在内部协议，约定由房产营销公司承担部分或全部佣金。然而，这种内部协议不能对抗购房者，即不能未经购房者同意就擅自处分其房款。
行业惯例或地方政策：
- 在某些地区或行业中，可能存在将房款用于抵偿佣金的惯例或政策。然而，这并不意味着这种行为在所有情况下都是合法的。您仍应根据具体情况和法律法规来判断其合法性。
建议：
- 如果您发现房产营销公司未经您同意擅自将您的房款用于抵偿开发商的佣金，您应立即与其沟通并要求返还房款。
- 如果沟通无果，您可以考虑向相关部门投诉或举报房产营销公司的违法行为，并寻求法律援助以维护自己的合法权益。
- 在未来的房屋买卖过程中，您应更加谨慎地阅读合同条款，了解自己的权利和义务，避免类似情况的发生。
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