开发商公寓托管租金抵扣房款是否合法，需根据具体情况分析。

1. 合同约定情况：

   • 如果开发商与购房者之间在购房合同中明确约定了公寓托管租金可以抵扣房款，并且该约定不违反法律法规的强制性规定，那么这种抵扣行为是合法的。双方应按照合同约定履行各自义务。

2. 无合同约定或约定不明情况：

   • 如果购房合同中未约定或约定不明确关于公寓托管租金抵扣房款的内容，那么开发商单方面主张抵扣可能构成违约行为。在此情况下，购房者有权拒绝开发商的抵扣要求，并要求开发商按照原购房合同的约定履行付款义务。

3. 法律法规限制：

   • 无论合同中是否有约定，开发商和购房者之间的任何行为都不能违反法律法规的强制性规定。例如，如果相关法律法规明确禁止了某种形式的抵扣或限制了抵扣的条件和范围，那么即使合同中有相关约定，该约定也是无效的。

4. 实际操作建议：

   • 在面对开发商提出的公寓托管租金抵扣房款的要求时，购房者应首先查看购房合同中是否有相关约定，并仔细阅读合同条款以确保自己的权益不受损害。
   • 如果合同中没有明确约定或约定不明确，购房者应与开发商进行协商，明确抵扣的具体条件、方式和范围，并确保这些约定符合法律法规的要求。
   • 在任何情况下，购房者都应保留好相关证据和文件，以便在发生纠纷时能够维护自己的合法权益。

综上所述，开发商公寓托管租金抵扣房款的合法性取决于购房合同中是否有相关约定以及这些约定是否符合法律法规的要求。因此，在处理此类问题时，建议购房者仔细审查购房合同并咨询专业律师的意见。如果你有相关法律问题或需要进一步的帮助，请直接向我咨询。