实习生请假扣加班费这一做法通常是不合理的。以下从几个方面进行详细分析：

1. 实习生身份与劳动权益：

   • 实习生虽然与正式员工在劳动关系上可能存在差异，但他们同样享有基本的劳动权益。这包括获得合理的劳动报酬、享受休息休假等。
   • 加班费是员工因超出正常工作时间工作而应获得的额外报酬，是员工劳动权益的一部分。实习生在加班时，同样应享有获得加班费的权利。

2. 请假与加班费的关系：

   • 请假是员工因个人原因需要暂时离开工作岗位的行为。在请假期间，员工不提供劳动，因此通常不享有该期间的工资或加班费。
   • 然而，这并不意味着用人单位可以随意扣除员工其他时间的加班费。加班费是基于员工实际加班时间计算的，与请假无直接关联。

3. 用人单位的合法操作：

   • 用人单位在制定规章制度时，应确保规章制度的合法性和合理性。扣除实习生加班费作为请假惩罚的做法，缺乏法律依据，且可能侵犯实习生的合法权益。
   • 如果实习生确实存在违反规章制度的行为，用人单位应依据合法程序进行处理，如警告、罚款（需符合法律规定）等，但不应直接扣除加班费。

4. 法律后果与建议：

   • 如果用人单位擅自扣除实习生加班费，实习生有权向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，维护自己的合法权益。
   • 对于实习生而言，建议保留好相关证据，如加班记录、请假条、工资条等，以便在需要时证明自己的权益。
   • 同时，我也建议用人单位在处理实习生请假和加班费问题时，应更加谨慎和合法，避免引发不必要的法律纠纷。

总结与建议：实习生请假扣加班费的做法通常是不合理的。用人单位应尊重实习生的劳动权益，合法合规地处理请假和加班费问题。如果实习生遇到此类问题，建议及时咨询专业律师或向劳动监察部门投诉，以维护自己的合法权益。如果你还有其他关于劳动工伤或劳动仲裁方面的问题，可以直接向我咨询。