结论：上班12天不做了，对方按9天算并扣除3天试工期是否合理，需根据具体情况判断，主要取决于双方是否事先有明确约定以及该约定是否合法。以下从不同角度进行分析：
一、双方有明确约定且约定合法的情况
约定内容：如果双方在劳动合同或入职协议中明确约定了试工期（或试用期）的天数，并且约定在试工期（或试用期）内离职的，用人单位可以按照实际出勤天数结算工资，同时扣除试工期（或试用期）内未出勤的天数对应的工资（或按约定方式处理），且该约定不违反法律法规的强制性规定。
合法性分析：根据《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，用人单位与劳动者可以约定试用期，但试用期包含在劳动合同期限内，且试用期的长度有明确的限制（如劳动合同期限三个月以上不满一年的，试用期不得超过一个月；劳动合同期限一年以上不满三年的，试用期不得超过二个月；三年以上固定期限和无固定期限的劳动合同，试用期不得超过六个月）。如果双方约定的试工期（或试用期）在法律规定的范围内，且扣除工资的方式不违反法律法规的强制性规定（如不低于当地最低工资标准等），则该约定是合法的。
结论：在此情况下，如果双方有明确约定且约定合法，那么上班12天不做了，对方按9天算并扣除3天试工期的做法可能是合理的。
二、双方无明确约定或约定不合法的情况
无约定情况：如果双方没有在劳动合同或入职协议中明确约定试工期（或试用期）的天数以及离职时的工资结算方式，那么用人单位单方面扣除3天试工期的做法可能缺乏法律依据。
约定不合法情况：如果双方约定的试工期（或试用期）超过了法律规定的长度，或者扣除工资的方式违反了法律法规的强制性规定（如低于当地最低工资标准等），那么该约定是违法的。
结论：在此情况下，上班12天不做了，对方按9天算并扣除3天试工期的做法是不合理的。劳动者有权要求用人单位按照实际出勤天数结算工资，并可以依法维护自己的合法权益。
三、建议与行动
核查约定：首先，劳动者应核查自己与用人单位签订的劳动合同或入职协议中是否有关于试工期（或试用期）的明确约定，以及离职时的工资结算方式。
沟通协商：如果发现用人单位的做法与约定不符或约定本身不合法，劳动者可以与用人单位进行沟通协商，要求用人单位按照实际出勤天数结算工资。
依法维权：如果沟通协商无果，劳动者可以向当地劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，依法维护自己的合法权益。
示例：假设劳动者与用人单位在劳动合同中明确约定了试用期为一个月，且约定在试用期内离职的，用人单位可以按照实际出勤天数结算工资。如果劳动者在试用期内工作了12天然后离职，那么用人单位按照9天结算工资并扣除3天试用期的做法（假设这3天是劳动者未出勤的天数且符合约定）是合理的。但如果双方没有这样的约定或约定不合法，那么用人单位的做法就是不合理的。
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