结论前置：上班四次打卡一次未打卡公司扣半天工资是否合法，主要取决于公司是否有合法有效的规章制度作为依据，以及扣钱行为是否符合相关法律法规的规定。以下从多个角度进行分析：
一、公司规章制度合法性角度
制度制定程序合法：
- 公司必须制定了明确的考勤制度，并且该制度需经过民主程序制定（如职工代表大会讨论通过）和公示或告知劳动者（如在公司内部公告栏公示、组织员工培训等）。
- 示例：若公司考勤制度规定未打卡视为旷工半天，并明确扣除相应工资，且该制度制定程序合法并已公示，则按照此制度扣钱是合法的。
制度内容合理：
- 考勤制度应明确打卡与工资扣除的具体关联，避免模糊或歧义条款。
- 示例：制度中应明确“每月允许X次未打卡补卡机会，超出部分按旷工半天处理，扣除半天工资”，这样的规定既合理又明确。
二、扣钱金额合理性角度
扣钱金额不得过高：
- 扣钱的金额应当合理，不能过分高于因未打卡可能给用人单位带来的损失。
- 法律依据：根据《工资支付暂行规定》第十六条，扣款金额不得超过劳动者当月工资的20%，且扣除后剩余工资不得低于当地最低工资标准。
- 示例：若员工月薪5000元，因一次未打卡扣除的金额不应超过1000元（即20%的限额），且扣除后工资仍需高于最低工资标准。
扣钱目的需正当：
- 扣钱应是为了弥补因未打卡可能给公司造成的损失，而非变相罚款或惩罚员工。
- 不合理情形：若公司以“管理成本”名义每次扣款50元且无对应损失证明，可能被认定为变相罚款，此行为不合法。
三、员工权益保护角度
员工有权了解制度：
- 员工在入职时应被告知公司的考勤制度和工资扣除规定，确保知情权。
- 建议：员工在签署劳动合同时，应仔细阅读并理解其中的考勤和工资条款。
员工有权申诉：
- 若公司无故扣减员工工资，员工可向人社局的劳动监察大队举报投诉，要求查处。
- 法律依据：员工也可依据《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》向劳动争议仲裁委员会申请劳动仲裁，要求支付被非法扣除的工资及赔偿金。
- 时效：在劳动关系终止的情况下，员工应自劳动关系终止之日起一年内提出劳动仲裁申请。
四、实际操作建议
与公司沟通：
- 若员工认为公司扣钱行为不合理，可首先与公司沟通，了解扣钱的具体原因和依据。
- 示例：员工可以询问公司是否有明确的考勤制度，以及自己未打卡是否确实给公司造成了损失。
保留证据：
- 员工应保留好与公司沟通的记录、工资条等证据，以备不时之需。
- 建议：员工可以通过邮件、短信或书面形式与公司沟通，并保留好相关记录。
寻求法律帮助：
- 若沟通无果，员工可寻求法律帮助，维护自己的合法权益。
- 说明：作为专业律师，我可以为你提供详细的法律咨询和代理服务，帮助你解决劳动纠纷问题。
总结：上班四次打卡一次未打卡公司扣半天工资是否合法，需结合公司规章制度、扣款金额及目的等因素综合判断。若公司制度合法、扣款金额合理且目的正当，则扣钱行为合法；反之，则可能构成对劳动者合法权益的侵犯。员工在遇到此类问题时，应首先与公司沟通了解情况，并保留好相关证据；若沟通无果，可寻求法律帮助维护自己的合法权益。