结论前置：企业拖欠工资三个月，员工在辞职时是有权获得年限经济补偿金的。

法律依据与适用情形

根据《中华人民共和国劳动合同法》第三十八条和第四十六条的规定，当用人单位未及时足额支付劳动报酬时，劳动者有权解除劳动合同，并且用人单位应当向劳动者支付经济补偿。这一规定直接适用于您所描述的情况，即企业拖欠工资三个月，员工因此选择辞职。

经济补偿的计算方式

经济补偿的计算主要依据劳动者在本单位的工作年限，具体标准如下：

• 工作年限计算：每满一年支付一个月工资的标准向劳动者支付；六个月以上不满一年的，按一年计算；不满六个月的，向劳动者支付半个月工资的经济补偿。
• 月工资标准：这里的“月工资”是指劳动者在劳动合同解除或者终止前十二个月的平均工资。如果劳动者月工资高于用人单位所在直辖市、设区的市级人民政府公布的本地区上年度职工月平均工资三倍的，向其支付经济补偿的标准按职工月平均工资三倍的数额支付，向其支付经济补偿的年限最高不超过十二年。

具体计算公式：

• 经济补偿金 = 工作年限 × 月工资
• 其中，工作年限按上述标准折算为整数年或半年；月工资为劳动合同解除或终止前十二个月的平均工资（有上限规定）。

示例：

假设小张在某公司工作了3年4个月，因公司拖欠工资离职，其前十二个月的平均工资为6000元，且该地区上年度职工月平均工资为5000元（未超过三倍上限）。则公司应支付的经济补偿金为：3.5年 × 6000元/年 = 21000元（注意，这里3年按3年计算，4个月按0.5年计算，合计3.5年）。

实际操作建议

1. 保留证据：在提出辞职前，务必收集并保留好公司拖欠工资的证据，如工资条、银行流水、工作记录、与公司的沟通记录等。这些证据将有助于后续维权。
2. 与公司协商：尝试与公司进行协商，要求支付拖欠的工资及经济补偿。如果协商无果，再考虑通过法律途径解决。
3. 申请劳动仲裁：若协商不成，可以向当地劳动人事争议仲裁委员会申请仲裁，要求公司支付拖欠的工资及经济补偿。在申请仲裁时，需要提交仲裁申请书、证据材料等。
4. 提起诉讼：对仲裁结果不满意的，还可以向人民法院提起诉讼。在诉讼过程中，需要遵循法院的诉讼程序，提交相关证据材料，并积极参与庭审活动。

注意事项

• 在辞职时，建议以书面形式通知公司，并明确说明辞职原因是因为公司拖欠工资。这样有助于在后续维权过程中证明自己的辞职是合法的，并有权获得经济补偿。
• 如果公司拒绝支付经济补偿或拖欠工资，不要轻易放弃维权。可以通过法律途径来维护自己的合法权益，包括申请劳动仲裁和提起诉讼等。

作为赵君男律师，我建议您在面对此类情况时，保持冷静并依法维权。如果您有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。