在诉讼中劳动关系认定事实成立，但诉讼请求仍被驳回，可能存在以下几种情况：

1. 诉讼请求不当或超出法律保护范围：

   • 即便劳动关系被认定成立，但如果你的诉讼请求本身存在问题，比如请求的赔偿金额过高、请求的事项不属于法律保护的范围（如请求公司支付非因工作原因产生的个人费用等），或者请求的事项与劳动关系无直接关联，法院可能会驳回你的诉讼请求。
   • 举例：你请求公司支付因个人原因产生的交通费用，但这并非因工作产生，且不在劳动法规定的赔偿范围内，因此法院会驳回此项请求。

2. 证据不足或证据效力存在问题：

   • 尽管劳动关系被认定，但如果你在证明其他关键事实（如工资标准、加班时长、未支付工资或加班费等）时，提供的证据不足或证据效力存在问题（如证据不真实、不合法、与案件无关联等），法院可能无法支持你的全部或部分诉讼请求。
   • 举例：你主张公司未支付加班费，但仅提供了自己记录的加班时间，没有公司确认或考勤记录等佐证，法院可能因证据不足而驳回此项请求。

3. 法律适用错误或理解偏差：

   • 在诉讼过程中，如果你对法律条文的理解存在偏差，或者错误地适用了法律，导致诉讼请求与法律规定不符，法院也会驳回你的诉讼请求。
   • 举例：你依据某条已废止的法规或司法解释提出请求，而该法规或司法解释已不再适用，法院会依据现行有效的法律进行裁决，并可能驳回你的请求。

4. 诉讼时效问题：

   • 如果你的诉讼请求超过了法律规定的诉讼时效期间，且没有中止、中断或延长的情形，法院也会驳回你的诉讼请求。
   • 举例：你主张公司拖欠工资，但自拖欠之日起已超过三年（一般劳动争议诉讼时效为一年，但具体可能因地区和案件类型而异），且没有证据证明存在诉讼时效中止、中断或延长的情形，法院会驳回你的此项请求。

5. 其他程序性或实体性问题：

   • 除了上述原因外，还可能存在其他程序性（如未按规定缴纳诉讼费、未按时出庭等）或实体性问题（如请求事项已通过其他途径解决、请求事项与已生效的裁判文书相冲突等），导致法院驳回你的诉讼请求。

针对上述情况，我建议你：

• 仔细审查诉讼请求：确保你的诉讼请求明确、具体、合法，且与劳动关系直接相关。
• 充分准备证据：收集并整理与诉讼请求相关的所有证据，确保证据的真实性、合法性和关联性。
• 正确理解法律：深入研究相关法律法规和司法解释，确保对法律条文的理解准确无误，并正确适用法律。
• 注意诉讼时效：及时行使权利，避免超过诉讼时效期间。
• 咨询专业律师：如果你对诉讼过程或法律条文存在疑问，或有其他法律问题，可以直接向我咨询，我会为你提供专业的法律建议和帮助。