企业职工违规收费的处理需根据违规性质、情节严重程度及企业规章制度，结合劳动法、刑法等相关法律规定，分情况采取不同措施，具体如下：

1. 企业内部处理

   • 调查核实：企业应首先通过内部调查（如查阅收费记录、询问相关人员、调取监控等）核实职工是否存在违规收费行为，并固定证据（如书面记录、电子数据、证人证言等）。
     
   • 依据规章制度处理：若职工行为违反企业《员工手册》《财务管理制度》等内部规定，企业可依据制度对其作出警告、记过、降薪、调岗、解除劳动合同等处分。需注意：
     
     • 规章制度需经民主程序制定（如职工代表大会讨论）并公示，否则可能因程序违法被认定无效；
       
     • 处理措施需与违规情节匹配（如轻微违规可警告，严重违规可解除合同）。
       
   • 追缴违规所得：企业有权要求职工退还违规收取的费用，并可要求其赔偿因违规行为给企业造成的损失（如客户流失、声誉损害等）。

2. 行政责任追究

   • 若职工违规收费行为涉嫌违反《价格法》《反不正当竞争法》等行政法规（如强制收费、价格欺诈），企业可向市场监管部门举报，由行政部门对职工或企业（若企业默许）作出行政处罚（如罚款、没收违法所得、责令整改等）。
     
   • 例如：职工以企业名义向客户收取“服务费”但未提供对应服务，可能构成“价格违法行为”，需承担行政责任。

3. 刑事责任追究

   • 若职工违规收费行为涉嫌犯罪（如职务侵占罪、非国家工作人员受贿罪、诈骗罪等），企业应立即向公安机关报案，由司法机关依法追究刑事责任。常见情形包括：
     
     • 职务侵占罪：职工利用职务便利，将企业财物非法占为己有（如将客户支付的费用截留私吞），数额较大的（6万元以上）；
       
     • 非国家工作人员受贿罪：职工索取或非法收受他人财物，为他人谋取利益（如收受客户“好处费”后提供优惠），数额较大的（6万元以上）；
       
     • 诈骗罪：职工以虚构事实或隐瞒真相的方法骗取他人财物（如伪造收费项目骗取客户钱款）。
       
   • 刑事责任可能涉及有期徒刑、拘役、罚金等，且企业可能因管理失职承担连带责任（如未尽到监督义务）。

4. 劳动争议处理

   • 若职工对企业的处理决定不服（如解除合同），可能引发劳动仲裁或诉讼。企业需在仲裁/诉讼中证明：
     
     • 职工存在违规行为（证据充分）；
       
     • 企业处理依据的规章制度合法有效；
       
     • 处理程序合法（如提前通知工会、听取职工申辩等）。
       
   • 若企业无法证明上述要点，可能被认定违法解除合同，需支付赔偿金（2N倍月工资）。

建议：企业应完善内部合规制度，明确收费标准及审批流程，定期开展法律培训，并建立举报机制以防范违规行为。若发现职工违规收费，需根据情节轻重选择合适处理方式，必要时咨询专业律师以确保程序合法、证据充分。如有具体案件细节，可直接向我咨询。