在协商解除劳动合同的过程中，通常不需要单独提交离职申请。这是因为协商解除劳动合同的本质是用人单位与劳动者通过平等协商，就解除劳动合同的相关事宜达成一致意见。这种解除方式强调的是双方的合意，只要双方签订协商解除劳动合同协议，并明确约定解除的时间、补偿等关键条款，该协议即具有法律效力，双方需按约履行。

离职申请一般是劳动者单方面向用人单位提出离职的意思表示，它不同于协商解除劳动合同中的双方合意。在某些特殊情况下，用人单位可能出于内部管理流程和档案记录的需要，要求劳动者提交离职申请。此时，劳动者可以按照要求提交，但应在申请中注明是基于协商一致解除劳动合同，以避免产生误解。

然而，从法律的角度和实际操作的主流观点来看，协商解除劳动合同无需再单独提交离职申请，因为双方已经通过协商达成了共识，这种合意已经替代了劳动者单方提出辞职的情形。

在实际操作中，劳动者应首先了解公司的具体要求。如果公司确实要求提交离职申请，那么劳动者可以按照公司的规定进行提交，并确保在申请中明确注明是基于协商一致解除劳动合同的。但无论是否需要提交离职申请，双方都应就解除的具体事宜进行明确约定，并以书面形式予以确认，这是保障双方权益的关键步骤。

总的来说，协商解除劳动合同时是否需要提交离职申请并非绝对，而是取决于公司的具体要求和双方的协商情况。但无论如何，确保协商结果的明确性和书面化是保障双方权益的重要原则。如有疑问或不明确之处，劳动者应及时与用人单位沟通，明确权责归属，避免后续可能出现的纠纷。