在协商一致离职的情况下，通常仍然需要填写离职申请，但这一流程的具体要求和目的可能因公司政策和实际情况有所不同。以下是对这一问题的详细解答：

一、离职申请的作用

离职申请是员工向公司正式提出离职意愿的书面文件，它标志着离职流程的正式开始。即使是在协商一致离职的情况下，填写离职申请也有其重要意义：

1. 明确离职意愿：通过书面形式明确表达离职的意愿，避免口头沟通可能带来的误解或遗漏。
2. 记录离职流程：作为离职流程的一部分，离职申请有助于公司记录和管理员工的离职过程，确保所有相关手续得到妥善处理。
3. 保障双方权益：离职申请中通常会包含离职日期、离职原因、工作交接等关键信息，这些信息对于保障公司和员工的双方权益都至关重要。

二、协商一致离职的特殊性

在协商一致离职的情况下，员工和公司已经就离职的相关事宜（如离职日期、经济补偿等）达成了共识。然而，这并不意味着可以省略离职申请这一环节。相反，填写离职申请可以进一步确认双方的共识，并作为后续手续办理的依据。

三、实际操作中的注意事项

1. 了解公司政策：不同公司可能有不同的离职流程和政策，因此在填写离职申请前，建议先了解公司的相关规定和要求。
2. 明确离职条款：在填写离职申请时，应确保所有离职条款（如离职日期、经济补偿、工作交接等）都已明确并达成共识。
3. 保留相关证据：为了保障自己的权益，建议在填写离职申请并提交给公司后，保留一份副本或相关证据，以备不时之需。

四、特殊情况下的处理

如果公司因特殊原因（如系统故障、流程调整等）无法及时处理离职申请，或者员工因紧急情况需要立即离职，双方可以协商并达成临时协议。然而，在这种情况下，也应尽快补办离职申请手续，以确保离职流程的完整性和合法性。

总结来说，协商一致离职时仍然需要填写离职申请，这是离职流程的一部分，有助于明确离职意愿、记录离职过程并保障双方权益。在填写离职申请时，应了解公司政策、明确离职条款并保留相关证据。如有特殊情况，双方应协商并达成临时协议，并尽快补办离职申请手续。