离职申请书中可以写双方协商一致，但需根据实际情况谨慎处理，具体分析如下：

1. 若双方已就离职条件达成一致
   若您与用人单位已就离职时间、工资结算、经济补偿、竞业限制等核心条款协商一致，可在离职申请书中明确记载“经双方协商一致，本人提出离职”。此时需注意：

   • 书面确认：建议将协商内容以书面协议（如《解除劳动合同协议书》）形式固定，避免仅在离职申请书中简单表述导致争议；
     
   • 条款完整性：需明确协商一致的具体内容（如离职日期、补偿金额、工作交接等），防止后续因条款模糊产生纠纷；
     
   • 法律效力：若双方签字盖章，该表述可作为证明协商一致的重要证据，但需确保内容不违反法律强制性规定（如未足额支付经济补偿等）。

2. 若双方未完全协商一致
   若仅您单方提出离职，或用人单位未同意协商条件（如未承诺支付补偿），则不建议在离职申请书中写“双方协商一致”，否则可能被认定为：

   • 自认协商一致：用人单位可能据此主张您主动离职且无争议，拒绝支付经济补偿或承担其他责任；
     
   • 证据风险：若后续发生纠纷，该表述可能被法院或仲裁机构采信，导致您主张权利时面临举证困难。
     建议：此时应明确写明“因个人原因提出离职”或“因用人单位未履行法定义务（如拖欠工资）被迫离职”，并保留协商过程的证据（如邮件、聊天记录等）。

3. 特殊情形：用人单位要求写“协商一致”
   若用人单位以不写“协商一致”就不批准离职或办理手续为由要求您配合，需警惕：

   • 变相免责：用人单位可能通过此表述规避支付补偿、开具离职证明等法定义务；
     
   • 合法性审查：若协商内容本身违法（如未缴纳社保、强迫离职等），即使写“协商一致”也无效，您仍可依法维权。
     建议：拒绝签署空白或内容不实的文件，必要时可向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁。

总结：离职申请书中是否写“双方协商一致”需结合实际情况判断。若已达成合法有效的协商，可明确记载并补充协议；若未协商或协商内容违法，则应避免使用该表述，并保留维权证据。如有疑问，可直接向我咨询具体操作方案。