机关提高司机工资待遇不违法。工资待遇是劳动合同的重要组成部分，其调整通常依据劳动合同的具体规定以及国家的相关法律法规。以下是具体的分析：
合同规定：
- 如果劳动合同中有明确的薪酬条款，包括薪酬数额、调整方式等，那么机关应当按照合同规定执行。
- 如果合同中没有明确的薪酬调整条款，但规定了薪酬应当与某种标准（如市场薪资水平、公司业绩等）挂钩，那么机关在调整薪酬时应当遵循这些标准。
法律法规：
- 机关作为用人单位，应当遵守《中华人民共和国劳动法》等相关法律法规，确保员工的薪酬待遇不低于法律规定的最低工资标准，并且按时足额支付。
- 提高司机工资待遇属于用人单位的自主管理权范畴，只要不违反法律法规和劳动合同的约定，就是合法的。
实际情况：
- 机关提高司机工资待遇可能是出于多种考虑，如市场薪资水平的上涨、司机工作量的增加、对司机工作表现的认可等。
- 只要这些提高薪酬待遇的行为符合法律法规和劳动合同的约定，就是合法的，不会构成违法。
综上所述，机关提高司机工资待遇不违法，但应当确保这一行为符合法律法规和劳动合同的约定。如果司机对薪酬待遇有异议，可以通过与机关协商、申请劳动仲裁等方式来维护自己的合法权益。