结论：单位能否因员工未通过特殊作业证考试而开除，需分情况讨论，具体如下：
- 若单位规章制度明确规定未取得特殊作业证可解除劳动合同，且该制度合法有效
根据《劳动合同法》第三十九条，劳动者严重违反用人单位规章制度的，用人单位可解除劳动合同。但需满足以下条件：
- 制度合法性：规章制度需经民主程序制定（如职工代表大会讨论、与工会协商等），且内容不违反法律强制性规定（如不得以“未考证”直接等同于“严重失职”）。
- 告知义务：单位需证明已将制度内容明确告知员工（如培训、签字确认等）。
- 因果关系：员工未考证需直接导致无法履行岗位职责（如电工未持证上岗可能引发安全隐患），且单位已提供培训或合理期限要求考证。
例外：若员工因不可抗力（如突发疾病、政策调整导致考试取消）未通过，单位不得以此为由解除合同。
若单位规章制度未明确规定，或规定违法
- 程序违法：若制度未经民主程序或未公示，单位不得依据该制度解除合同。
- 内容违法：若制度将“未考证”直接定义为“严重违纪”或“不能胜任工作”，可能被认定为违法解除。例如，员工已通过部分考试或正在备考，单位单方面解除可能构成侵权。
- 经济补偿义务：此时单位解除合同需支付赔偿金（2N，N为工作年限对应的月工资）。
特殊行业或岗位的法定要求
- 根据《安全生产法》《特种作业人员安全技术培训考核管理规定》等，部分岗位（如电工、焊工、高处作业等）必须持证上岗。若员工因故意不考证导致无法履职，单位可依据《劳动合同法》第四十条第二项（“劳动者不能胜任工作，经过培训或调整岗位仍不能胜任”）解除合同，但需提前30日通知或支付代通知金（N+1）。
- 关键点：单位需证明已提供培训或调整岗位的机会，且员工仍无法满足要求。
建议：
- 对员工：若单位以此为由解除合同，可要求单位出具书面解除通知，并核查制度合法性及解除程序是否合规。若存在违法情形，可申请劳动仲裁主张赔偿金。
- 对单位：制定规章制度时需确保程序合法、内容合理，并在解除合同前留存员工未考证导致无法履职的证据（如工作记录、培训记录等）。
如有进一步疑问，可直接向我咨询具体场景下的法律风险。