结论：员工没有特种作业证，公司确实会面临处罚。这一规定旨在强化安全生产管理，防止和减少生产安全事故的发生。

一、法律依据与规定

根据《中华人民共和国安全生产法》第三十条的明确规定，生产经营单位的特种作业人员必须接受专门的安全技术培训，并通过考核取得《中华人民共和国特种作业操作证》后，方可上岗作业。这是保障安全生产的重要法律基础，任何违反这一规定的行为都将受到法律的制裁。

二、公司面临的处罚情况

1. 初次违规：

   • 依据《中华人民共和国安全生产法》第九十七条第七项，若公司安排未取得相应资格的人员从事特种作业，将被责令限期改正，并处以十万元以下的罚款。这一处罚旨在促使公司及时纠正违法行为，确保特种作业人员的资质符合要求。

2. 逾期未改正：

   • 若公司在规定期限内未进行整改，将继续面临更严厉的处罚。包括责令停产停业整顿，并处以十万元以上二十万元以下的罚款。同时，对其直接负责的主管人员和其他直接责任人员，将处以二万元以上五万元以下的罚款。这一处罚措施旨在通过经济手段和行政手段相结合的方式，迫使公司重视并改正违法行为。

三、主要负责人面临的处罚情况

公司主要负责人作为安全生产的第一责任人，对员工特种作业无证上岗负有不可推卸的责任。根据《中华人民共和国安全生产法》第九十四条的规定：

1. 未履行安全管理职责：

   • 主要负责人若未履行本法规定的安全生产管理职责，将被责令限期改正，并处以二万元以上五万元以下的罚款。这一处罚旨在促使主要负责人切实履行安全管理职责，确保公司的安全生产。

2. 逾期未改正的严重后果：

   • 若逾期未改正，将面临五万元以上十万元以下的罚款，并可能导致公司被责令停产停业整顿。此外，如果因员工特种作业无证上岗导致重大伤亡事故或造成其他严重后果，主要负责人还可能构成重大责任事故罪等犯罪，需要承担刑事责任。这不仅涉及经济上的损失，更可能对公司声誉和主要负责人的个人前途造成严重影响。

四、建议与措施

为避免不必要的法律风险和经济损失，公司和主要负责人应高度重视特种作业人员的持证上岗问题。具体措施包括：

1. 加强培训和管理：

   • 确保特种作业人员接受专门的安全技术培训，并通过考核取得相应资格。同时，定期对特种作业人员进行复训和考核，确保其技能和资质始终符合要求。

2. 定期开展安全生产检查：

   • 及时发现并纠正无证上岗等违规行为。通过定期的安全生产检查，可以确保公司的安全生产管理制度得到有效执行。

3. 建立健全安全生产管理制度和责任追究机制：

   • 明确各级管理人员和员工的安全生产职责，确保安全生产工作的有效实施。同时，建立责任追究机制，对违反安全生产规定的行为进行严肃处理。

五、实际案例分析

以某化工企业为例，该企业因安排未取得特种作业资格证的员工进行危险化学品设备维修作业，被当地应急管理部门查处。该企业最终被责令限期改正，并被处以8万元罚款；同时，企业主要负责人也被处以3万元罚款。这一案例充分展示了法律对特种作业无证上岗行为的严厉惩处态度。

六、总结与提醒

员工特种作业无证上岗是一个严重的安全生产问题，不仅关乎员工的生命安全，也关系到公司的生存与发展。因此，公司和主要负责人必须严格遵守相关法律法规，确保所有特种作业人员都持证上岗。如果你或你的公司面临类似问题，或有任何关于劳动工伤、刑事辩护、交通事故等领域的法律问题，都可以直接向我咨询。