在职期间加班费的追诉年限主要取决于劳动关系的存续状态以及当地的具体法律规定，具体分析如下：
劳动关系存续期间：
- 在劳动关系仍然存续的情况下，劳动者对于加班费的追讨不受仲裁时效期间的限制。这意味着，无论加班行为发生在多久之前，只要劳动关系未解除，劳动者都有权要求用人单位支付相应的加班费。这一规定旨在保护劳动者在劳动关系中的相对弱势地位，确保其合法权益得到充分保障。
劳动关系终止后：
- 一旦劳动关系终止，劳动者追讨加班费的期限将受到限制。根据《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》第二十七条的规定，劳动关系终止后，劳动者应当自劳动关系终止之日起一年内提出加班费的追讨请求。这一规定是为了促使劳动者及时行使自己的权利，避免长时间拖延导致证据灭失或难以收集。如果超过这个期限，用人单位可能会提出时效抗辩，导致劳动者面临败诉风险。
举证责任分配与超过两年的加班费争议：
- 在司法实践中，对于超过两年的加班费争议，举证责任分配较为复杂。根据相关规定，用人单位对劳动者的工资支付记录等证据负有保存两年的义务。因此，对于两年以内的加班费争议，一般由用人单位承担是否支付加班费的举证责任。而对于超过两年的部分，劳动者则需要自己提供证据证明用人单位存在未支付加班费的情况。如果劳动者无法提供有效证据，可能难以得到法律的支持。
地区法律规定差异与特殊情况处理：
- 不同地区对于加班费追讨的时效规定可能存在差异。因此，劳动者在追讨加班费前，应当首先查阅当地的劳动法律法规和相关司法解释，了解具体的时效规定。此外，在某些特殊情况下，如用人单位存在恶意拖欠加班费、劳动者因不可抗力等原因无法及时主张权利等，法律可能会提供更为灵活的保护机制。
建议与行动指南：
- 及时主张权利：无论劳动关系是否存续，劳动者一旦发现用人单位存在未支付加班费的情况，应及时主张自己的权利，避免错过时效期限。
- 保留证据：劳动者应妥善保留与加班相关的证据，如考勤记录、加班审批表、工作记录等，以便在追讨加班费时提供有力支持。
- 咨询专业律师：如果劳动者在追讨加班费过程中遇到法律难题或不确定如何操作，可以直接向我咨询，我会根据具体情况提供专业的法律建议和帮助。
示例说明：
假设劳动者小李在某公司工作期间存在加班情况，但公司未支付加班费。小李在劳动关系存续期间一直未主张该权利。后来，小李因个人原因离职，并在离职后一年内发现公司未支付加班费的情况。此时，小李可以依据《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》的规定，在离职后一年内向劳动争议仲裁委员会提起仲裁申请，要求公司支付加班费。如果小李在离职后超过一年才主张权利，则可能面临败诉风险。
总之，在职期间加班费的追诉年限是一个复杂而重要的问题，劳动者应充分了解相关法律法规和时效规定，及时主张自己的权利并保留好相关证据。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。