关于工厂保险扣工人工资是否合理的问题，这实际上涉及到了工厂扣工资的合法性判断，需要结合具体情况及相关法律法规来综合考量。
首先，我们要明确的是，工厂无故或不合理地扣减工人工资是违法的。根据《中华人民共和国劳动法》第五十条和《中华人民共和国劳动合同法》第三十条的规定，工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人，且用人单位应当按照劳动合同约定和国家规定，向劳动者及时足额支付劳动报酬。这意味着，工厂不得随意克扣或拖欠工人的工资。
然而，在特定情况下，工厂是可以依法扣减工人工资的。这些合法扣减工资的情形包括但不限于：
代扣代缴：工厂可以依法从工人工资中代扣代缴个人所得税、社会保险费用（工人个人负担部分）、法院判决或裁定要求的抚养费或赡养费等。这是法律允许的扣减，且工厂需要提供相应的扣缴证明。
工人过错导致经济损失：如果工人因故意或重大过失给工厂造成经济损失，工厂可以要求工人赔偿，并从工资中扣除相应款项。但需要注意的是，每月扣除的部分不得超过工人当月工资的20%，且扣除后的剩余工资不得低于当地月最低工资标准。
违反劳动纪律：如果工厂依法制定的规章制度中明确规定了旷工、迟到早退等违反劳动纪律的行为可以扣工资，并且该规章制度已经向工人公示或告知，那么工厂在工人违反这些规定时扣减工资是合法的。
工人绩效不达标：如果绩效工资作为浮动工资部分，且工人绩效未达标，工厂可以通过绩效考核减少其绩效工资。但这也需要依据工厂的绩效考核制度和劳动合同中的相关约定来执行。
对于工厂以保险为由扣减工人工资的情况，我们需要具体分析：
如果工厂是依法为工人缴纳社会保险，并从工人工资中代扣代缴个人应负担的部分，那么这是合法的。但工厂需要提供社会保险缴费证明，并确保扣减的金额与工人个人应负担的部分相符。
如果工厂以保险为由，但并未实际为工人缴纳社会保险，或者扣减的金额超过了工人个人应负担的部分，那么这种扣减就是违法的。工人有权要求工厂返还被不合理扣减的工资，并可以向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁来维护自己的权益。
最后，如果工人认为工厂扣减工资的行为不合理或违法，可以采取以下措施来维护自己的权益：
综上所述，工厂以保险为由扣减工人工资是否合理，需要依据具体情况和相关法律法规来判断。工人应了解自己的权益和维权途径，在面临扣减工资问题时能够采取适当的措施来保护自己的合法权益。