结论：针对您描述的情况，公司因员工医疗期满后未上班而按旷工处理并最终解除劳动合同，这一行为是否合法需根据具体情况判断。以下从不同角度为您详细分析：

一、医疗期满后的处理原则

1. 医疗期定义：医疗期是指企业职工因患病或非因工负伤停止工作治病休息不得解除劳动合同的时限。医疗期的长度根据职工实际参加工作年限和在本单位工作年限确定，一般为3个月到24个月不等。

2. 医疗期满后的义务：医疗期满后，员工应当返回工作岗位继续工作。如果员工因病情严重无法从事原工作，公司应安排其从事力所能及的其他工作。若员工既不能从事原工作，也不能从事公司另行安排的工作，公司可以依据《劳动合同法》的相关规定，提前三十日以书面形式通知员工本人或者额外支付员工一个月工资后，解除劳动合同。

二、公司解除劳动合同的合法性分析

1. 合法解除的情形：

   • 如果员工在医疗期满后，既未返回工作岗位，也未向公司说明情况或申请延长医疗期，且公司已书面通知其上班而员工仍不上班，公司可以依据规章制度将员工的行为视为旷工，并依据《劳动合同法》第三十九条的规定，以严重违反公司规章制度为由解除劳动合同。

2. 可能存在的违法情形：

   • 未履行通知义务：如果公司在解除劳动合同前未书面通知员工上班，或者未给予员工合理的解释和申辩机会，直接解除劳动合同可能构成违法解除。
   • 未考虑员工实际情况：如果员工因病情严重确实无法返回工作岗位，且已向公司说明情况并提供相关医疗证明，公司未考虑员工的实际情况而直接解除劳动合同，也可能构成违法解除。
   • 规章制度不合法：如果公司的规章制度中关于旷工和解除劳动合同的规定与法律法规相冲突，或者未经民主程序制定并公示，那么公司依据这些规章制度解除劳动合同也是违法的。

三、员工应对策略

1. 核实公司行为合法性：员工应首先核实公司解除劳动合同的行为是否合法，包括是否履行了通知义务、是否考虑了员工的实际情况、规章制度是否合法等。

2. 收集证据：如果员工认为公司解除劳动合同的行为违法，应收集相关证据，如医疗证明、公司通知、规章制度等，以备后续维权使用。

3. 申请劳动仲裁或提起诉讼：如果员工与公司无法协商解决争议，可以向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，或者向人民法院提起诉讼，要求公司承担违法解除劳动合同的法律责任。

四、法律后果

1. 如果公司行为合法：员工需接受解除劳动合同的事实，并按照公司规定办理离职手续。

2. 如果公司行为违法：公司需承担违法解除劳动合同的法律责任，包括支付赔偿金、继续履行劳动合同等。赔偿金的计算标准通常为经济补偿标准的二倍，经济补偿按劳动者在本单位工作的年限，每满一年支付一个月工资的标准向劳动者支付。六个月以上不满一年的，按一年计算；不满六个月的，向劳动者支付半个月工资的经济补偿。

建议：鉴于具体情况可能因地区和具体案情而有所不同，如果您或您身边的人遇到类似问题，建议直接向我咨询，以便根据具体情况提供更准确的法律建议。