结论前置：公司以你擅自离岗为由扣工资，若无法定理由，则此行为违法，你可以依法申请劳动仲裁以维护自身权益。
法律背景与解析
工资支付原则：
- 根据《中华人民共和国劳动法》第五十条，工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人，不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。这是保障劳动者获得劳动报酬的基本法律原则。
辞职权利与程序：
- 依据《中华人民共和国劳动合同法》第三十七条，劳动者有权提前三十日（试用期内提前三日）以书面形式通知用人单位解除劳动合同。按照法定程序辞职后，公司无权以辞职为由扣发工资。
工资结算规定：
- 《工资支付暂行规定》第九条明确，劳动关系解除或终止时，用人单位应一次性付清劳动者工资。这进一步强调了劳动者在离职时应获得的工资权益。
特殊情况说明
- 若公司能证明你的擅自离岗（若确实存在且违反公司规章制度或劳动合同约定）给其造成了经济损失，如未按规定办理工作交接导致的业务受影响或直接经济损失，公司可按劳动合同约定要求赔偿。但需注意，每月扣除的赔偿费用不得超过你当月工资的20%，且扣除后剩余工资不得低于当地月最低工资标准。
申请劳动仲裁的准备与流程
尝试协商：
- 在正式申请仲裁前，建议首先与公司进行友好协商，尝试解决纠纷。这有助于节省时间和精力，并可能达成双方都能接受的解决方案。
确认仲裁委员会：
- 确定向劳动合同履行地或用人单位所在地的劳动争议仲裁委员会提出申请。这是申请劳动仲裁的第一步，确保选择正确的仲裁机构。
准备仲裁材料：
- 仲裁申请书：详细阐述仲裁请求、事实和理由。这是仲裁申请的核心文件，需要清晰、准确地表达你的诉求。
- 证据材料：包括劳动合同、工资条、考勤记录（证明你并未擅自离岗或离岗时间、原因等）、离职证明、银行流水等，以全面证明劳动关系、工资数额及扣发工资的事实。证据是仲裁成功的关键，务必准备充分。
- 身份证明：提供身份证原件及复印件。这是确认你身份的必要文件。
- 用人单位工商信息：通过国家企业信用信息公示系统查询并打印。这有助于确认用人单位的身份和基本信息。
提交申请：
- 将准备好的材料提交至仲裁委员会，等待其五日内作出是否受理的决定。这是仲裁流程的正式开始，需耐心等待仲裁委员会的受理通知。
参加仲裁庭审：
- 若申请被受理，按通知时间地点参加庭审，陈述主张并提供证据。仲裁庭将根据双方陈述和证据进行审理，并最终作出裁决。在庭审过程中，要保持冷静、理性，充分陈述自己的主张和证据。
专业建议
- 在处理此类纠纷时，务必保持冷静和理性，避免情绪化行为。同时，要充分了解自己的权益和法律程序，以便更好地维护自己的合法权益。
- 若你对劳动仲裁流程或相关法律法规不熟悉，可以直接向我咨询。作为专业律师，我可以为你提供具体的法律指导和帮助。
综上所述，公司无正当理由因擅自离岗（若确实存在且违反规定）扣发工资是违法的，劳动者有权依法申请劳动仲裁以维权。在申请过程中，应充分准备相关证据材料，并按照法定程序进行操作。若你有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。