公司给产假两个月，其余时间请假按缺勤处理，这一做法是否合法，需分情况讨论：
若女职工符合法定产假条件，且公司规定的两个月产假少于法定标准：
- 根据《女职工劳动保护特别规定》，女职工生育享受98天产假，其中产前可以休假15天；难产的，增加产假15天；生育多胞胎的，每多生育1个婴儿，增加产假15天。若公司仅给予两个月产假，明显少于法定标准，则公司的做法不合法。女职工有权要求公司按照法定标准给予产假，并在此期间享受相应的工资待遇。若公司拒绝，女职工可以向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，维护自己的合法权益。
若女职工符合法定产假条件，且公司规定的两个月产假与法定标准一致或更长，但其余时间请假按缺勤处理：
- 在这种情况下，如果女职工在产假结束后，因个人原因需要继续请假，且请假事由不符合公司规定的带薪休假条件（如病假、事假等需符合公司规定并经过批准），那么公司按照缺勤处理是合法的。因为产假是女职工的法定权益，但产假结束后，女职工的请假行为就应当遵循公司的规章制度。当然，如果女职工的请假事由符合公司规定的带薪休假条件，公司则应当按照相应规定给予带薪休假。
若公司规章制度中未明确规定产假及请假制度，或规定与法律法规相冲突：
- 如果公司规章制度中未明确规定产假及请假制度，或者规定的内容与法律法规相冲突，那么公司的做法可能不合法。在这种情况下，女职工有权要求公司按照法律法规的规定给予产假和相应的工资待遇。同时，公司也应当及时修订和完善规章制度，确保其与法律法规保持一致。
法律建议：
- 对于女职工而言，在享受产假前，应当了解自己所在地区的产假标准以及公司的规章制度，确保自己的权益得到保障。如果公司给予的产假少于法定标准或规章制度存在不合理之处，女职工可以与公司进行沟通协商，要求公司按照法律法规的规定执行。
- 对于公司而言，应当制定合法合规的规章制度，明确产假及请假制度，并确保其与法律法规保持一致。同时，公司也应当加强对员工的法律法规培训，提高员工的法律意识，避免因规章制度不合规而引发的劳动纠纷。
可能后果：
- 如果公司违反法律法规规定，给予女职工少于法定标准的产假或未按照规定支付产假工资，女职工可以向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，要求公司承担相应的法律责任。这可能包括支付拖欠的工资、加付赔偿金等。
- 如果女职工在产假结束后未经批准擅自离岗或请假事由不符合公司规定，公司按照缺勤处理是合法的。但公司也应当确保处理过程合法合规，避免因处理不当而引发的劳动纠纷。
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