结论：在交通事故且对方全责，同时构成工伤的情况下，医生开具的病假期间工资原则上由工伤保险基金或用人单位承担，具体取决于是否参加工伤保险以及病假性质。以下为详细分析：

一、交通事故与工伤的竞合处理

根据《工伤保险条例》及相关司法实践，员工在上下班途中受到非本人主要责任的交通事故伤害，可认定为工伤。当交通事故责任完全由第三方（即对方）承担时，员工同时享有交通事故损害赔偿请求权和工伤保险待遇请求权，二者属于不同的法律关系，可并行主张。

二、病假期间工资的承担主体

1. 工伤保险基金支付情形
   若用人单位已为员工缴纳工伤保险，病假期间工资（即停工留薪期工资）由工伤保险基金按原工资福利待遇标准支付，最长不超过12个月。具体流程为：

   • 员工需向社保部门申请工伤认定；
     
   • 认定后，凭医疗证明和停工留薪期确认书，由工伤保险基金直接支付工资。

2. 用人单位支付情形

   • 未参保员工：若用人单位未依法缴纳工伤保险，所有工伤保险待遇（包括停工留薪期工资）均由用人单位承担。
     
   • 超出停工留薪期：若病假超过12个月（需经劳动能力鉴定委员会确认需延长），超出部分的工资可能按病假工资标准（如当地最低工资的80%）由用人单位支付，但需结合地方规定。

3. 交通事故赔偿与工伤待遇的衔接
   根据《社会保险法》第四十二条，医疗费用、康复费用等实际发生的费用不得重复报销，但工资损失（如停工留薪期工资与交通事故误工费）可分别主张。若交通事故赔偿中已包含误工费，工伤保险基金或用人单位在支付工资时可能要求扣除已获赔偿部分，但司法实践中存在争议，部分地区支持“双赔”（即工资部分不扣除）。

三、特殊情形提示

1. 病假合理性审查
   医生开具的病假需符合医疗常规，若用人单位对病假长度有异议，可申请劳动能力鉴定委员会确认。若病假被认定为不合理，用人单位可能无需支付工资。

2. 地方性规定差异
   部分省份（如广东、江苏）明确规定，工伤保险待遇与交通事故赔偿中“工资损失”部分可兼得；而另一些地区可能要求扣除重复部分。建议结合当地司法实践进一步核实。

四、操作建议

1. 立即申请工伤认定：自事故发生之日起30日内，由用人单位申请；逾期未申请的，员工或其近亲属可在1年内直接申请。
   
2. 保留证据：包括交通事故责任认定书、医疗证明、病假单、工资流水等，以证明工资损失和工伤事实。
   
3. 协商或诉讼：若用人单位或工伤保险基金拒付工资，可先协商；协商不成，可申请劳动仲裁或提起诉讼。

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