结论：劳动者和母子公司分别签订劳动合同后发生劳动争议，劳动仲裁起诉的对象需根据具体情况确定，一般可能起诉母公司、子公司或两者共同作为被申请人。

详细分析：

1. 劳动合同的相对性原则：

   • 劳动合同是劳动者与用人单位之间确立劳动关系、明确双方权利和义务的协议。根据合同的相对性原则，劳动者通常应向与其签订劳动合同的用人单位主张权利。
   • 若劳动者与子公司签订了劳动合同，且实际工作也在子公司进行，那么在发生劳动争议时，劳动者一般应将子公司作为劳动仲裁的被申请人。

2. 母公司与子公司的法律关系：

   • 母公司是指拥有另一个公司一定比例以上的股份或通过协议方式能够对另一个公司实行实际控制的公司。子公司则是指其股份被另一公司所控制或依照协议被另一公司实际控制、操纵的公司。
   • 母公司与子公司是独立的法人实体，各自承担独立的法律责任。除非有特别约定或法律另有规定，母公司通常不对子公司的债务或劳动争议承担直接责任。

3. 特殊情况下的起诉对象：

   • 关联关系或混同用工：如果母公司与子公司存在关联关系，且在实际用工过程中存在混同用工的情况（如劳动者同时为母公司和子公司工作，或工作安排、工资发放等由母公司或子公司统一管理），那么劳动者在劳动仲裁时可能可以将母公司和子公司共同作为被申请人。
   • 子公司无法独立承担责任：如果子公司因各种原因（如破产、解散等）无法独立承担法律责任，且母公司作为子公司的控股股东或实际控制人存在过错或滥用权利的情况，劳动者可能可以依据相关法律规定，将母公司作为共同被申请人或追加为被申请人。

4. 法律建议：

   • 在发生劳动争议时，劳动者应首先审查自己与哪家公司签订了劳动合同，并确认实际工作单位。
   • 如果存在混同用工或子公司无法独立承担责任等特殊情况，劳动者应收集相关证据（如工作安排、工资发放记录、公司关联关系证明等），以便在劳动仲裁时支持自己的主张。
   • 劳动者在提起劳动仲裁前，可以咨询专业律师，以更准确地确定起诉对象和制定诉讼策略。

后续行动建议：

• 如果您正面临此类劳动争议，建议您先收集相关证据，如劳动合同、工作记录、工资单等，以证明您与用人单位之间的劳动关系及争议事实。
• 您可以根据具体情况，选择将母公司、子公司或两者共同作为劳动仲裁的被申请人。
• 在提起劳动仲裁前，不妨先向我咨询，我会根据您的具体情况，为您提供更详细的法律建议和诉讼策略。