结论：在交了全款只签了购房协议，发现补充协议与正式合同有冲突的情况下，您有权选择不签补充协议，但能否要求退款需根据具体情况分析，主要取决于合同条款、双方协商以及法律规定。

分析如下：

1. 合同条款的审查：

   • 首先，需要仔细审查购房协议和补充协议的内容，特别是关于冲突条款的具体表述。如果补充协议中的条款与购房协议中的核心条款（如房屋价格、交付时间、房屋质量等）存在直接冲突，且这种冲突无法通过合理解释或协商解决，那么您有权基于合同条款的不一致性提出异议。
   • 如果购房协议中已有明确约定，如“本协议与补充协议不一致的，以本协议为准”或类似条款，那么您可以依据这些条款拒绝签署补充协议，并要求按照购房协议执行。

2. 双方协商的可能性：

   • 在发现冲突后，您应首先尝试与开发商进行协商，寻求双方都能接受的解决方案。如果开发商同意修改补充协议或提供其他补偿措施，那么问题可能得到妥善解决，无需走到退款这一步。
   • 协商过程中，您可以明确表达自己的诉求和担忧，并要求开发商提供合理的解释和解决方案。如果开发商态度积极，愿意配合解决问题，那么退款可能不是最佳选择。

3. 法律规定的适用：

   • 如果协商无果，且您认为补充协议的条款严重损害了您的合法权益，您可以考虑依据《中华人民共和国民法典》中关于合同无效或可撤销的规定来维护自己的权益。例如，如果补充协议中的条款存在欺诈、胁迫、显失公平等情形，您有权请求人民法院或仲裁机构撤销或变更该条款。
   • 此外，如果购房协议和补充协议均未明确约定冲突解决方式，且双方无法达成一致意见，那么您还可以考虑依据《中华人民共和国民法典》中关于合同解释的规定，结合合同目的、交易习惯以及诚信原则等，对冲突条款进行合理解释，并据此主张自己的权益。

4. 退款的可能性与条件：

   • 退款并非轻易可行，它通常需要满足一定的条件。例如，如果购房协议中明确约定了“因补充协议与本协议冲突导致合同无法履行的，买方有权要求退款”等类似条款，那么您在符合这些条件的情况下可以要求退款。
   • 如果没有这样的明确约定，您则需要通过协商、诉讼或仲裁等方式来争取退款。在这个过程中，您需要提供充分的证据证明补充协议与购房协议的冲突以及这种冲突对您造成的损失。

建议：

• 在处理此类问题时，建议您保持冷静和理性，不要轻易采取过激行动。
• 首先尝试与开发商进行协商，寻求双方都能接受的解决方案。
• 如果协商无果，您可以考虑咨询专业律师（即向我咨询），了解自己的法律权益和可能的维权途径。
• 在必要时，您可以依法向人民法院提起诉讼或向仲裁机构申请仲裁，以维护自己的合法权益。