结论前置：员工在单位发生工伤3年后，三方更换合同，一般情况下对工伤鉴定和赔偿的影响不大，但具体还需根据合同更换的具体情况、工伤认定及赔偿的进展阶段等因素综合判断。以下从不同角度进行分析：
一、合同更换对工伤认定的影响
工伤认定时效：
- 根据《工伤保险条例》第十七条，职工发生事故伤害或者按照职业病防治法规定被诊断、鉴定为职业病，所在单位应当自事故伤害发生之日或者被诊断、鉴定为职业病之日起30日内，向统筹地区社会保险行政部门提出工伤认定申请。遇有特殊情况，经报社会保险行政部门同意，申请时限可以适当延长。
- 用人单位未按前款规定提出工伤认定申请的，工伤职工或者其近亲属、工会组织在事故伤害发生之日或者被诊断、鉴定为职业病之日起1年内，可以直接向用人单位所在地统筹地区社会保险行政部门提出工伤认定申请。
- 分析：工伤认定有明确的时效限制，且该时效通常与合同更换无直接关联。因此，在工伤发生3年后，无论合同是否更换，只要未超过工伤认定的时效（通常为1年，但单位申请可延长至30日后的合理期限，且存在特殊情况下的延长可能），员工仍可申请工伤认定。不过，若已超过时效，则可能无法再申请工伤认定。
合同更换与工伤事实的关系：
- 工伤认定是基于员工在工作时间、工作场所内因工作原因受到的事故伤害或职业病。这一事实与员工与哪个单位签订合同无直接关系。
- 分析：即使三方更换了合同，只要工伤事实清楚，且未超过工伤认定时效，员工仍可基于原工伤事实申请工伤认定。合同更换本身不会改变工伤事实的存在。
二、合同更换对工伤赔偿的影响
赔偿义务主体的确定：
- 工伤赔偿的义务主体通常是用人单位。在三方更换合同的情况下，需要明确新的合同主体是否承接了原用人单位的工伤赔偿义务。
- 分析：如果新的合同主体明确承接了原用人单位的工伤赔偿义务，则员工应向新的合同主体主张工伤赔偿。如果新的合同主体未承接该义务，或合同更换存在争议，则可能需要通过法律途径确定赔偿义务主体。
赔偿标准与合同更换的关系：
- 工伤赔偿的标准通常根据员工的工伤等级、工资水平、当地政策等因素确定。这些因素与员工与哪个单位签订合同无直接关系。
- 分析：合同更换本身不会改变工伤赔偿的标准。但是，如果合同更换导致了员工工资水平的变化，或者影响了工伤等级的评定（如因新工作环境导致旧伤复发等），则可能间接影响工伤赔偿的数额。
赔偿程序的进行：
- 工伤赔偿的程序通常包括工伤认定、劳动能力鉴定、赔偿协商或仲裁等步骤。这些步骤的进行与合同更换无直接关系。
- 分析：无论合同是否更换，员工都应按照法定程序进行工伤赔偿的申请和主张。合同更换可能带来的变化是赔偿义务主体的变更或赔偿协商对象的变更，但不影响赔偿程序的本身。
三、特殊情况下的考虑
- 如果合同更换涉及到用人单位的合并、分立、转让等情形，根据《工伤保险条例》第四十三条，用人单位分立、合并、转让的，承继单位应当承担原用人单位的工伤保险责任；原用人单位已经参加工伤保险的，承继单位应当到当地经办机构办理工伤保险变更登记。
- 分析：在这种情况下，合同更换对工伤赔偿的影响主要体现在赔偿义务主体的变更上，但不影响员工主张工伤赔偿的权利和赔偿标准的确定。
建议：针对您的情况，我建议您首先确认工伤认定是否已超过时效，并尽快进行工伤认定申请（如果尚未申请且未超过时效）。同时，仔细审查合同更换的具体条款，明确新的合同主体是否承接了原用人单位的工伤赔偿义务。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。