结论前置：买卖合同中逾期交货违约金约定为货款的日万分之五，其合法性需结合具体合同类型、实际损失情况、法律法规的强制性规定以及合同双方的自愿性等多种因素综合判断。在大多数情况下，只要该约定是双方真实意思表示，且不违反法律法规的强制性规定，该约定通常是有效的。
一、合法性分析
合同双方的自愿性：
- 根据《中华人民共和国民法典》第五百八十五条，当事人可以约定一方违约时应当支付的违约金数额或计算方法。这意味着，如果合同双方在平等、自愿的基础上约定了违约金为货款的日万分之五，且该约定不违反法律法规的强制性规定，也不损害国家、集体或第三人的利益，则该约定合法有效。
实际损失情况：
- 法院在判断违约金是否过高时，会综合考虑合同的履行情况、当事人的过错程度、预期利益以及实际损失等因素。日万分之五的违约金比例（换算成年利率约为18.25%）并不必然导致违约金过高，这取决于合同金额、违约期限及实际损失等具体情况。例如，若因逾期交货导致买方遭受了较大的经济损失，且该损失与日万分之五的违约金比例相当或更高，则该约定通常会被认为是合理的。
法律法规的强制性规定：
- 在一般的货物买卖合同中，没有法律法规明确禁止约定日万分之五的违约金。然而，在某些特殊领域，如金融借款合同中，违约金与利息、复利等总计不能超过合同成立时一年期贷款市场报价利率（LPR）的四倍。但货物买卖合同通常不受此限制，除非合同本身涉及金融借贷等特殊领域。
二、特殊情况分析
违约金过高或过低的调整：
- 若日万分之五的违约金比例导致违约金过高，给违约方造成了不合理的负担，违约方可以请求法院适当减少。根据《民法典》及相关司法解释，若违约金超过造成损失的30%，可能被视为“过分高于”，法院有权根据请求进行调整。反之，如果约定的违约金过低，不足以弥补守约方的损失，守约方也可以请求法院增加违约金。
合同类型与行业惯例：
- 在不同的合同类型和行业惯例中，违约金的约定可能有所不同。例如，在金融借贷领域，信用卡逾期罚息普遍采用日万分之五的标准；而在商业合同中，该比例也常见于工程承包、设备租赁等场景。因此，在货物买卖合同中约定日万分之五的违约金，也体现了市场对该标准的接受度。
三、建议与指导
合理约定违约金：
- 在签订买卖合同时，双方应充分考虑实际损失情况、合同类型及法律法规的要求，合理约定违约金比例或数额。避免约定过高或过低的违约金，以减少后续纠纷的发生。
及时咨询与应对：
- 在发生违约纠纷时，建议及时向我咨询，我会根据具体情况进行法律分析和策略制定。例如，若认为违约金过高或过低，可以协助你向法院提出调整请求；若对方违约，可以协助你主张违约金及赔偿损失等。
保留证据与记录：
- 在合同履行过程中，建议双方保留好相关证据和记录，如交货单、验收单、付款凭证等。这些证据在发生纠纷时将起到至关重要的作用，有助于证明实际损失情况、违约事实及责任归属等。
综上所述，买卖合同中逾期交货违约金约定为货款的日万分之五，在大多数情况下是合法的。但具体合法性还需根据合同类型、实际损失情况、法律法规的强制性规定以及合同双方的自愿性等多种因素综合判断。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。