员工打卡但未在岗位上，领导是否违法需视具体情况而定。以下是对此问题的详细分析：
一、员工打卡但未在岗位上的可能情形
- 员工个人原因：员工可能因私事暂时离开岗位，如去洗手间、接电话、短暂休息等。这种情况下，员工通常会在短时间内返回岗位，且未对工作造成实质性影响。
- 员工违反公司规定：员工可能故意或过失地长时间离开岗位，如外出办私事、在非工作区域长时间逗留等。这种情况下，员工的行为可能违反了公司的规章制度或劳动纪律。
- 公司管理问题：公司可能因管理不善或安排不当，导致员工打卡后无法及时到达岗位，如打卡机位置不合理、岗位安排不明确等。
二、领导是否违法的分析
员工个人原因且未造成影响：
- 若员工因私事短暂离开岗位，且未对工作造成实质性影响，领导通常不会因此违法。领导可以提醒员工注意工作时间和纪律，但无需采取严厉措施。
员工违反公司规定：
- 若员工长时间离开岗位，违反了公司的规章制度或劳动纪律，领导有权根据公司规定对员工进行处理。这种处理可能包括口头警告、书面警告、扣发工资、解除劳动合同等。领导在处理时需确保程序合法、证据充分，且处理措施与员工违规行为相匹配。若领导处理不当，如无故辞退员工或采取其他非法手段，则可能构成违法。
公司管理问题：
- 若因公司管理不善或安排不当导致员工打卡后无法及时到达岗位，领导应首先反思公司管理问题，并采取措施加以改进。领导不应将责任归咎于员工，更不应因此采取非法手段对待员工。
三、法律建议
对于员工：
- 员工应遵守公司的规章制度和劳动纪律，按时到岗工作。若因特殊情况需要离开岗位，应提前向领导请假或说明情况。
- 若员工认为领导的处理措施不当或存在违法行为，可以与公司协商解决，或向劳动监察部门投诉、申请劳动仲裁等。
对于领导：
- 领导应加强对员工的管理和监督，确保员工按时到岗工作。若发现员工违规行为，应按照公司规定进行处理，并确保程序合法、证据充分。
- 领导应反思公司管理问题，及时改进管理措施，避免类似问题再次发生。
四、可能的法律后果
- 若领导违法处理员工：如无故辞退员工、扣发工资等，员工有权要求公司承担法律责任，包括支付赔偿金、恢复劳动关系等。
- 若员工违规且给公司造成损失：公司有权要求员工承担赔偿责任，但需确保赔偿金额合理且证据充分。
总之，员工打卡但未在岗位上，领导是否违法需视具体情况而定。若您遇到此类问题，建议直接向我咨询，以便根据具体情况提供更详细的法律建议。