员工因请病假超过三个月被公司辞退，是有权获得相应补偿的，但具体补偿情况需根据是否处于医疗期及公司解除劳动合同的合法性来判断。以下从不同角度为您详细分析：
一、医疗期内的合法保护
根据《中华人民共和国劳动合同法》第四十二条的规定，劳动者患病或者非因工负伤，在规定的医疗期内，用人单位不得依据该法第四十条（无过失性辞退）和第四十一条（经济性裁员）的规定解除劳动合同。这意味着，如果员工仍在规定的医疗期内，公司无权以请病假为由辞退员工，否则将构成违法解除劳动合同。
二、医疗期满后的处理
合法解除情况：
- 若员工在规定的医疗期满后，不能从事原工作，也不能从事由用人单位另行安排的工作，用人单位可以依法解除劳动合同，但需支付经济补偿金。
- 经济补偿金的计算标准为：按劳动者在本单位工作的年限，每满一年支付一个月工资；六个月以上不满一年的，按一年计算；不满六个月的，向劳动者支付半个月工资的经济补偿。这里的月工资是指劳动合同解除或终止前十二个月的平均工资。
违法解除情况：
- 若员工仍在医疗期内，或医疗期满后公司未按照法定程序解除劳动合同（如未提前三十日以书面形式通知劳动者本人或额外支付一个月工资），则构成违法解除劳动合同。
- 在此情况下，员工有权要求公司按照经济补偿标准的二倍支付赔偿金。
三、员工维权途径
与公司协商：
- 员工可首先尝试与公司沟通，指出公司辞退行为的违法性，要求继续履行劳动合同或支付相应的赔偿金。
劳动监察投诉：
- 若协商无果，员工可向当地劳动监察部门投诉，提交如劳动合同、病假条、工资条等相关证据，由劳动监察部门对公司的违法行为进行查处。
劳动仲裁与诉讼：
- 员工还可向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，要求公司支付违法解除劳动合同的赔偿金。仲裁过程中需提供充分证据支持自己的主张。
- 如对仲裁结果不满，员工可在规定期限内向人民法院提起诉讼。
四、注意事项
病假证明的真实性：
- 员工在申请病假时，应确保提供的病假证明真实有效，以避免因虚假病假导致的法律纠纷。
证据材料的准备：
- 在与公司协商、投诉或仲裁过程中，员工应准备好所有相关证据材料，如劳动合同、工资条、考勤记录、请假审批记录、辞退通知等，以证明自己的劳动关系及被违法辞退的事实。
总结来说，员工因请病假超过三个月被公司辞退，其权益是否得到保障取决于是否处于医疗期内以及公司解除劳动合同的合法性。若公司违法解除劳动合同，员工有权获得经济补偿或赔偿金，并可通过多种法律途径来维护自己的合法权益。在实际操作中，员工应充分了解相关法律法规，准备好相关证据材料，以确保自己的权益得到有效保障。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。