结论：缺勤扣绩效后是否还按原工资扣款，需依据劳动合同、规章制度及法律规定综合判断。若合同或规章有明确规定且合法合规，用人单位可按约定执行；若无相关规定或规定不合法，用人单位不得随意扣减工资。以下从多个角度进行详细分析：
一、法律基础与工资构成
- 法律基础：根据《中华人民共和国劳动合同法》，用人单位不得无故克扣劳动者工资，除非存在法定情形（如劳动者因个人原因给用人单位造成损失）或劳动合同、规章制度中有明确规定。
- 工资构成：工资通常包括基本工资和绩效工资等部分。基本工资是劳动者提供正常劳动后应得的固定报酬，而绩效工资则根据员工工作表现、成果等评定，与绩效任务完成情况直接相关。
二、缺勤对绩效与工资的影响
- 绩效工资扣减：如果缺勤影响了绩效任务的完成，用人单位有权根据规章制度和劳动合同扣减相应的绩效奖金。这是合理的，因为绩效工资本身就是与工作表现挂钩的。
- 基本工资扣减：员工缺勤期间，用人单位通常可以拒绝支付其缺勤期间的基本工资。但关键在于，这种扣减是否合法合规，以及是否超出了合理范围。
三、缺勤后工资处理的具体情形
有明确规定且合法合规：如果劳动合同或规章制度中明确规定了缺勤时绩效工资和基本工资的扣减方式，且这种规定不违反法律法规（如扣除后工资不低于当地最低工资标准），则用人单位有权按约定执行。
- 例子：假设某员工月基本工资为3000元，绩效工资为2000元。劳动合同规定，缺勤一天扣减基本工资的1/30，并扣减绩效工资的相应比例。若该员工缺勤一天，则基本工资扣减100元（3000/30），绩效工资扣减相应比例（如按缺勤天数占当月工作日的比例计算）。
无相关规定或规定不合法：如果劳动合同或规章制度中没有明确规定缺勤时工资的扣减方式，或者规定不合法（如扣除后工资低于当地最低工资标准），则用人单位不得随意扣减工资。
- 例子：假设某员工月工资为5000元（未明确区分基本工资和绩效工资），劳动合同或规章制度中未规定缺勤时工资的扣减方式。若该员工缺勤一天，用人单位不得随意扣减其工资，除非能证明缺勤给用人单位造成了实际损失，且扣减金额合理。
四、特殊情况与操作建议
- 最低工资标准：即使劳动合同或规章制度中有相关规定，扣除后的工资也不得低于当地最低工资标准。否则，用人单位的做法违法，劳动者有权要求补足差额。
- 争议解决：如果劳动者对用人单位的扣减行为有异议，可以通过劳动争议调解、仲裁等途径维护自己的合法权益。
- 操作建议：
- 用人单位应完善劳动合同和规章制度，明确缺勤扣绩效和工资的具体情形和标准，并确保规定的合法性和合规性。
- 劳动者在签订劳动合同时应仔细阅读条款，了解自己的权益和义务，避免日后产生纠纷。
五、总结与进一步思考
缺勤扣绩效后是否还按原工资扣款，是一个需要根据具体情况综合判断的问题。用人单位和劳动者都应遵守相关法律法规和合同约定，确保各自权益得到保障。如果你或你身边的人遇到了类似问题，可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供更详细的法律建议。