缺勤扣款是否算工资总额，需分情况讨论，具体如下：
缺勤扣款的基本原则
- 缺勤时，用人单位通常会扣除劳动者基本工资中的部分，而非全部工资。这是因为基本工资是劳动者正常工作时间内提供正常劳动应得的报酬底线，而津贴、奖金等其他组成部分往往与绩效、出勤率等因素挂钩。
- 重要结论：无论采用何种计算方式，扣除后的工资总额必须确保不低于当地最低工资标准，且必须符合《中华人民共和国劳动法》及相关法律法规的规定。
缺勤扣款的具体情况与计算方法
- 一般情形下：
- 若劳动合同或公司规章制度中有明确约定，缺勤扣款通常是按基本工资的一定比例来扣。例如，月计薪天数为21.75天，若员工缺勤1天，则扣除的工资为基本工资除以21.75天。此时，扣除的款项是从基本工资中扣除，但计算后的剩余工资仍属于工资总额的一部分。
- 在特定严重违纪情况下（如连续旷工达到一定天数），且规章制度经过民主程序制定并向劳动者公示告知，可能扣除全部工资（但这种情况较少且要求严格）。若真的扣除全部工资，则工资总额将相应减少为零或接近零（若存在未扣除的津贴、奖金等）。
- 无明确约定时：从公平合理原则出发，通常是参照基本工资或正常出勤月工资来按比例计算扣除缺勤工资。扣除后的剩余工资同样属于工资总额的一部分。
- 特殊情形：
- 法定节假日、带薪年假、病假等情况下劳动者依法享有相应待遇，即使缺勤也不能扣工资。这些情况下的工资应全额计入工资总额。
- 因用人单位原因导致劳动者缺勤（如停工停产等），用人单位应按劳动合同规定的标准支付工资；超过一个工资支付周期且劳动者未提供正常劳动的，也应按国家有关规定办理，不能随意扣工资。这些情况下的工资同样应全额计入工资总额。
- 计算方法示例：
- 扣除计算法：当月工资总额 = 全月工资 - 日工资 × 缺勤天数。
- 累加计算法：当月工资总额 = 日工资 × 出勤天数。
- 具体采用哪种方法需根据公司规章制度和劳动合同确定，但无论哪种方法，都需确保扣除后的工资总额不低于当地最低工资标准。
公司规章制度与劳动合同的影响
- 具体的缺勤扣款方法和标准可能会受到公司规章制度和劳动合同的影响。因此，劳动者在接受缺勤扣款时，应仔细查看相关条款和规定，确保自己的权益不受侵害。
- 若公司规章制度或劳动合同中的缺勤扣款条款违反法律法规或显失公平，劳动者有权提出异议并要求修改。
法律后果与争议解决途径
- 如果用人单位扣工资的行为不合理、不合法，劳动者首先应与用人单位协商解决；协商不成的，可以向劳动监察部门投诉或者申请劳动仲裁维护自身权益。
- 劳动者在维护自身权益时，应保留好相关证据（如劳动合同、工资条、缺勤记录等），以便在争议解决过程中证明自己的主张。
总结与建议：缺勤扣款是否算工资总额需根据具体情况判断，但无论如何扣除，都需确保扣除后的工资总额不低于当地最低工资标准。劳动者应了解自己的权益和义务，仔细查看公司规章制度和劳动合同中的相关条款；用人单位也应依法依规管理，共同维护和谐稳定的劳动关系。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。