若药监局查到过期酒水且代理商决定不再继续经营，代理商仍需承担相应的法律责任，具体处理方式需根据实际情况分情况讨论：
- 行政责任层面
根据《中华人民共和国食品安全法》第三十四条，禁止经营超过保质期的食品。若代理商被药监局（现市场监管部门）查获过期酒水，无论是否继续经营，均可能面临行政处罚，包括：
- 没收违法经营的过期酒水；
- 罚款：货值金额不足一万元的，处五万元以上十万元以下罚款；货值金额一万元以上的，处货值金额十倍以上二十倍以下罚款；
- 情节严重的，可能被吊销许可证（如代理商持有食品经营许可证）。
关键点：行政责任不因代理商停止经营而免除，需配合调查并接受处罚。
- 民事责任层面
若过期酒水已销售给消费者并造成损害（如健康受损），代理商仍需承担民事赔偿责任，包括：
- 赔偿消费者损失（如医疗费、误工费等）；
- 若代理商已注销或停止经营，消费者可向其股东、实际控制人等主张权利（需证明存在财产混同或恶意注销等情形）。
建议：即使停止经营，也应保留相关销售记录、消费者沟通记录等证据，以应对潜在纠纷。
- 刑事责任层面（极端情况）
若代理商明知酒水过期仍大量销售，且销售金额达到刑事立案标准（如销售金额五万元以上），可能构成《刑法》第一百四十三条规定的“销售不符合安全标准的食品罪”，面临：
- 有期徒刑或拘役；
- 并处罚金。
关键点：刑事责任需以“明知”和“严重后果”为前提，但停止经营不构成免责事由。
行动建议：
- 立即停止销售并封存过期酒水，避免进一步违法；
- 配合药监局调查，如实说明情况（如进货渠道、销售记录等）；
- 若已停止经营，需依法办理注销登记，并妥善处理未售出商品及消费者投诉；
- 咨询专业律师，评估行政处罚合理性及民事赔偿风险，制定应对方案。
温馨提示：食品经营需严格遵守保质期管理，即使停止经营，过往违法行为仍可能被追溯。如有进一步疑问，可直接向我咨询。