在行政诉讼中，法院将不合法证据作为定案依据确实属于严重违反法定程序，这主要是因为不合法证据在合法性、真实性和关联性上存在严重问题，无法客观、公正地反映案件事实。以下是对这一问题的详细分析：

1. 不合法证据的合法性存疑：

   • 解释：行政诉讼中的证据必须严格遵守法定程序收集。若证据是通过严重违反法定程序（如无合法搜查令强行进入公民住宅收集证据、使用利诱、欺诈、胁迫、暴力等不正当手段获取证据）的方式获得的，其合法性将受到严重质疑。
   • 法律依据：相关行政法律法规对证据收集的程序有明确规定，如《中华人民共和国行政诉讼法》及相关司法解释中关于证据收集、审查、认定的规定。
   • 举例：若行政机关在没有合法搜查令的情况下，强行进入公民住宅并收集了相关证据，该证据因违反法定程序而失去合法性，不能作为定案依据。

2. 不合法证据的真实性难以保障：

   • 解释：不合法证据往往是在不正当手段下获得的，其真实性可能受到严重影响。例如，通过利诱、欺诈、胁迫等手段获取的证据，可能是被诱导或强迫下产生的，无法客观反映事实。
   • 法律依据：证据的真实性是证据的基本属性之一，不合法证据因收集手段的不正当性，其真实性难以得到保障。
   • 举例：若通过威胁证人获取的虚假陈述作为证据，该证据因缺乏真实性而不能作为定案依据。

3. 不合法证据的关联性受质疑：

   • 解释：证据的关联性是指证据与案件事实之间的客观联系。不合法证据可能因收集手段的不正当性而与案件事实失去关联，或者其关联性受到严重质疑。
   • 法律依据：证据的关联性是证据被采纳为定案依据的重要条件之一，不合法证据因可能缺乏关联性而不能被采纳。
   • 举例：若收集的证据与案件事实无直接关联，或者因收集手段的不正当性而导致其关联性受到质疑，该证据将不能作为定案依据。

4. 严重违反法定程序对诉讼公正性的影响：

   • 解释：将不合法证据作为定案依据，不仅违反了法定程序，还可能对诉讼的公正性造成严重影响。诉讼的公正性要求证据的收集、审查、认定等环节都必须严格遵守法律规定，确保案件的公正审理。
   • 法律依据：诉讼公正性是司法制度的基本原则之一，违反法定程序收集证据并作为定案依据，将严重损害诉讼的公正性。
   • 举例：若法院将不合法证据作为定案依据，可能导致案件处理结果的不公正，损害当事人的合法权益，甚至引发社会舆论的质疑和不满。

法律建议：

• 对于当事人而言，若发现行政机关在收集证据时存在严重违反法定程序的行为，应及时向法院提出异议，并要求排除不合法证据。
• 法院在审理行政诉讼案件时，应严格审查证据的合法性、真实性和关联性，确保只有符合法定要求的证据才能被采纳为定案依据。
• 行政机关在收集证据时，应严格遵守法定程序，确保证据的合法性和真实性，以维护诉讼的公正性和当事人的合法权益。

可能后果：

• 若法院将不合法证据作为定案依据，可能导致案件处理结果的不公正，损害当事人的合法权益。
• 当事人有权对法院的判决提出上诉或申请再审，要求法院重新审查证据并作出公正判决。
• 行政机关若因收集证据不合法而败诉，可能面临行政责任或民事赔偿等法律后果。

综上所述，行政诉讼中法院将不合法证据作为定案依据确实属于严重违反法定程序。这不仅损害了诉讼的公正性，还可能对当事人的合法权益造成严重影响。因此，在行政诉讼中，必须严格遵守法定程序收集、审查、认定证据，确保案件的公正审理和判决结果的准确性。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。