结论：单位给员工定制工装，合同有两年有效期，并不意味着必须在两年内摊销完毕。摊销期限的确定需综合考虑合同约定、会计准则以及税法规定。
详细分析：
合同约定角度：
- 如果合同中明确规定了工装的摊销期限，并且该期限与合同的有效期（两年）相一致或另有明确约定，那么单位应当按照合同约定的期限进行摊销。
- 若合同中未明确规定摊销期限，或者规定的期限与合同有效期不一致，则不能直接以合同有效期作为摊销期限。
会计准则角度：
- 根据会计准则，工装作为固定资产或低值易耗品（取决于其价值和使用期限），其摊销期限应基于其预计使用寿命来确定。
- 如果工装的预计使用寿命超过两年，那么摊销期限可以长于两年；如果预计使用寿命短于两年，则摊销期限应相应缩短。
- 会计准则还要求摊销方法应当合理，能够反映工装在使用过程中的价值消耗情况。
税法规定角度：
- 税法对于固定资产的折旧（摊销）期限也有相应规定，但通常这些规定提供的是最低折旧年限，单位可以在不低于税法规定的最低年限内，根据实际情况确定具体的折旧年限。
- 对于低值易耗品，税法可能允许一次性摊销或按照其他方法进行摊销，具体取决于其价值和使用情况。
法律建议：
- 单位在定制工装时，应在合同中明确约定摊销期限，以避免后续争议。
- 在确定摊销期限时，单位应综合考虑工装的预计使用寿命、会计准则以及税法规定，确保摊销方法的合理性和合规性。
- 如果单位对摊销期限的确定存在疑问或不确定如何操作，建议咨询专业会计师或税务师，以确保符合相关法律法规和会计准则的要求。
可能后果：
- 如果单位未按照合同约定、会计准则或税法规定进行摊销，可能会面临税务风险或会计处理不当的风险。
- 在极端情况下，如果摊销处理不当导致财务报表失真或税务申报错误，单位可能会受到税务机关的处罚或面临其他法律后果。
因此，单位在定制工装并确定摊销期限时，应谨慎处理并遵循相关法律法规和会计准则的要求。如有任何疑问或需要进一步的法律建议，请直接向我咨询。