结论前置：员工个人申请离职后，又以公司没给交社保为由起诉公司要经济补偿，法院是否支持需分情况讨论，具体如下：
根据《劳动合同法》第三十八条和第四十六条的规定，用人单位未依法为劳动者缴纳社会保险费的，劳动者可以解除劳动合同，并且用人单位应当向劳动者支付经济补偿。经济补偿按劳动者在本单位工作的年限，每满一年支付一个月工资的标准向劳动者支付。六个月以上不满一年的，按一年计算；不满六个月的，向劳动者支付半个月工资的经济补偿。
在这种情况下，即使员工最初是个人申请离职，但如果离职原因是公司未依法缴纳社保，且员工在离职时或离职后能够提供充分证据证明这一点（如工资条、社保缴费记录、与公司沟通社保问题的书面证据等），那么法院很可能会支持员工关于经济补偿的诉求。
如果公司能够提供证据证明已经依法为员工缴纳了社保（如社保缴费凭证、社保部门出具的缴费证明等），或者员工无法提供充分证据证明公司未依法缴纳社保是其离职的原因，那么员工以公司没给交社保为由起诉要求经济补偿的诉求，法院可能不会支持。
此外，如果员工在离职时已经明确表示离职原因与社保无关，或者员工在离职后的一段时间内才提出以公司未交社保为由要求经济补偿，且无法提供合理理由解释为何在离职时未提出此诉求，法院也可能对员工的诉求持谨慎态度。