公司以不能胜任工作为由辞退员工，员工可依法维权，具体处理方式如下：

1. 核实公司辞退的合法性

   • 法律依据：根据《劳动合同法》第四十条，公司以不能胜任工作为由辞退员工，需满足两个条件：一是员工确实不能胜任工作（通常需有明确的考核标准及员工未达标的证据）；二是公司需对员工进行培训或调整工作岗位，若仍不能胜任，方可提前30日书面通知或额外支付1个月工资后解除劳动合同。
   • 员工应对：若公司未履行培训或调岗程序，直接辞退，则属于违法解除劳动合同。员工可要求公司继续履行合同或支付赔偿金（2N，N为工作年限对应的月工资）。

2. 收集证据，准备维权

   • 关键证据：劳动合同、工资条、考核记录、培训或调岗通知（如有）、辞退通知等。
   • 维权途径：若公司违法辞退，员工可向当地劳动监察大队投诉，或申请劳动仲裁，主张赔偿金、未结工资、加班费等权益。

3. 注意程序细节

   • 辞退通知：公司需出具书面辞退通知，口头辞退无效。若公司未出具，员工可要求公司出具，或通过录音、聊天记录等方式固定证据。
   • 离职手续：员工应配合办理离职手续，但需注意保留相关证据，避免公司以“未办理离职手续”为由拒付工资或赔偿。

4. 协商与诉讼选择

   • 协商解决：若公司愿意协商，员工可根据实际情况接受补偿方案，但需确保补偿不低于法定标准。
   • 劳动仲裁/诉讼：若协商无果，员工可申请劳动仲裁，对仲裁结果不服的，还可向法院提起诉讼。

总结：公司以不能胜任工作为由辞退员工，需严格遵守法定程序。若公司违法辞退，员工可依法维权，主张赔偿金等权益。如有疑问或需进一步帮助，可直接向我咨询。