公司仅以不胜任为由辞退工作两年的员工，可能构成违法解除劳动合同，员工有权要求公司支付经济赔偿金。针对这一问题，我们可以从以下几个方面进行分析：
一. 公司辞退员工的合法性分析
不胜任工作的认定：根据《劳动合同法》第四十条第（二）项，劳动者不能胜任工作，经过培训或者调整工作岗位，仍不能胜任工作的，用人单位提前三十日以书面形式通知劳动者本人或者额外支付劳动者一个月工资后，可以解除劳动合同。因此，公司仅以不胜任为由直接辞退员工是不够的，还必须经过培训或调岗后仍不胜任的步骤。
辞退程序的合法性：即使员工确实不胜任工作，公司也需要按照法律规定的程序进行辞退，包括提前通知、支付代通知金等。如果公司未按照法定程序进行，则构成违法辞退。
二. 员工权益及救济途径
经济赔偿金：如果公司构成违法解除劳动合同，根据《劳动合同法》第八十七条，用人单位违反本法规定解除或者终止劳动合同的，应当依照本法第四十七条规定的经济补偿标准的二倍向劳动者支付赔偿金。因此，员工有权要求公司支付双倍的经济补偿金。
维权途径：员工可以通过与公司协商、向劳动监察部门投诉或提起劳动仲裁等方式来维护自己的合法权益。
三. 结论与建议
综上所述，公司仅以不胜任为由辞退工作两年的员工，很可能构成违法解除劳动合同。员工应当收集相关证据，如工作记录、辞退通知书等，以证明公司的辞退行为违法，并据此要求公司支付经济赔偿金。我建议员工在维权过程中保持冷静，理性沟通，必要时可寻求专业法律援助。如有进一步需要，您可以继续咨询我。