若公司以不能胜任工作为由辞退员工，赔偿问题需分情况讨论：

1. 公司合法解除劳动合同的情形
   根据《劳动合同法》第四十条，若员工不能胜任工作，经过培训或调整工作岗位后仍不能胜任，公司可提前三十日书面通知或额外支付一个月工资后解除劳动合同。此时，公司需支付经济补偿金，标准为：
   

• 工作年限：每满一年支付一个月工资；
  
• 六个月以上不满一年：按一年计算；
  
• 不满六个月：支付半个月工资。
  月工资指劳动合同解除前十二个月的平均工资，且若高于当地上年度职工月平均工资三倍，则按三倍封顶计算，补偿年限最高不超过十二年。

1. 公司违法解除劳动合同的情形
   若公司未履行培训或调岗程序，或未提前三十日通知（未支付代通知金），直接以不能胜任工作为由辞退员工，则构成违法解除。此时员工可主张：
   

• 赔偿金：经济补偿标准的二倍（即“2N”）；
  
• 继续履行合同：若员工要求恢复劳动关系，公司需继续履行原合同。
  

关键风险提示：

• 举证责任：公司需证明员工“不能胜任工作”（如绩效考核不达标、工作失误等），且需提供培训或调岗的书面证据；
  
• 程序合法性：解除程序需符合《劳动合同法》第四十条、第四十三条的规定，否则可能被认定为违法解除；
  
• 代通知金：若公司选择额外支付一个月工资代替提前通知，需按员工上月工资标准支付。
  

建议行动：
若您遇到此类情况，建议立即收集劳动合同、工资记录、绩效考核表、培训或调岗通知等证据，并依据具体情形向公司主张权利。如有争议，可依法申请劳动仲裁或提起诉讼。