针对事业单位工作人员长期不上班突然又上班的情况，单位应当依据相关法律法规及规章制度，结合员工的实际情况，进行妥善且细致的处理。以下是我为您提供的详细处理建议：
一、核实情况与了解原因
首先，单位应当核实该员工长期不上班的具体情况，包括缺勤的起始时间、缺勤天数以及是否有任何请假或报备记录。同时，与该员工进行沟通，了解其长期不上班的具体原因，是否存在合理的请假事由，如病假、事假等，或者是否有其他特殊情况导致无法上班。
二、依据规章制度进行处理
若员工存在旷工行为：
- 根据单位考勤制度，未经请假或请假未获批准而擅自离岗视为旷工。对于长期旷工的员工，单位应依据《中华人民共和国劳动合同法》第三十九条及《事业单位工作人员管理条例》第十五条的相关规定，结合旷工天数和情节严重程度，给予相应的纪律处分，如警告、记过、降低岗位等级、撤职或开除等。
- 在处理前，单位应向员工发出书面通知，要求其解释缺勤原因，并给予合理期限进行改正。若员工在规定期限内未作出合理解释或未改正，单位可依法依规进行处理。
若员工存在合理请假事由但未按规定办理手续：
- 对于因病或其他特殊原因无法上班的员工，若其确实存在合理请假事由但未按规定办理请假手续，单位应要求其补办相关手续，并提供相应证明。同时，根据单位规定，对未经批准或手续不全的缺勤部分，仍按旷工处理，但可酌情减轻处分。
三、考虑人性化管理与帮助
沟通协商：
- 在处理过程中，单位应与员工进行充分沟通，了解其不上班的具体困难和需求，尝试通过协商解决问题。例如，若员工因家庭原因或个人健康问题导致长期无法上班，单位可考虑提供一定的帮助或支持。
提供帮助与支持：
- 对于存在特殊情况需要单位照顾或支持的员工，单位可在合法合规的前提下，提供相应的帮助，如调整工作岗位、安排弹性工作时间等，以帮助员工更好地平衡工作与生活。
四、加强制度建设与宣传
完善规章制度：
- 单位应建立健全的请假制度、考勤制度等，明确请假条件、程序和期限，以及旷工的认定标准和处分措施。同时，确保规章制度的合法性和合理性，避免出现歧义或漏洞。
加强宣传与教育：
- 单位应加强对规章制度的学习和宣传，提高员工对规章制度的认识和遵守意识。通过定期组织培训、发放宣传资料等方式，确保员工了解并遵守单位的相关规定。
五、针对突然上班的处理
对于该员工突然上班的情况，单位应首先核实其身份和上班意图，确保其确实为该单位员工且有意回归工作岗位。然后，根据其长期不上班的处理结果和当前情况，进行妥善安排。若员工已接受处分并愿意改正，单位可为其提供必要的培训和指导，帮助其尽快适应工作岗位；若员工对处理结果有异议或存在其他问题，单位应进一步与其沟通协商，寻求妥善解决方案。
综上所述，事业单位在处理长期不上班的员工时，应严格遵循法律法规和单位规章制度，同时兼顾员工的实际情况和合理需求。通过合法的程序、合理的经济处罚、必要的纪律处分以及人性化的管理措施，确保处理的公正性和有效性，维护单位的正常秩序和员工的合法权益。