结论：中介叫您在用人单位干满三个月后去办离职是否违法，需根据具体情况判断，包括您与中介、用人单位之间的法律关系，以及离职的具体原因和程序等。以下从不同角度为您详细分析：
一、法律关系角度
若您与中介签订的是劳动合同，且被派遣至用人单位工作：
- 根据《劳动合同法》的相关规定，劳务派遣单位（中介）应当与被派遣劳动者（您）订立二年以上的固定期限劳动合同，按月支付劳动报酬。
- 在此情况下，若中介无正当理由要求您提前离职，可能构成违法解除劳动合同，您有权要求中介继续履行合同或支付赔偿金。
- 若用人单位因经营不善等原因需要裁员，也应按照法定程序进行，并支付相应的经济补偿。
若您与中介签订的是劳务合同，而非劳动合同：
- 劳务合同关系下，双方的权利义务主要由合同约定，不受《劳动合同法》的直接保护。
- 若中介违反合同约定要求您离职，您可能需要根据合同条款寻求救济，如要求中介承担违约责任等。
若您直接与用人单位签订劳动合同，中介仅作为介绍人：
- 在此情况下，中介无权直接要求您离职。离职事宜应由您与用人单位协商解决。
- 若用人单位无正当理由要求您离职，您同样有权要求用人单位继续履行合同或支付赔偿金。
二、离职原因和程序角度
合法离职：
- 若您因个人原因（如找到更好的工作、家庭原因等）或合同到期等原因主动提出离职，且按照法定程序（如提前通知用人单位）办理离职手续，则中介的要求不构成违法。
- 若用人单位因您不符合录用条件、严重违反规章制度等原因解除劳动合同，且符合法定程序，则中介的要求也不构成违法。
违法离职：
- 若中介或用人单位无正当理由（如歧视、报复等）要求您离职，且未按照法定程序进行，则可能构成违法解除劳动合同。
- 在此情况下，您有权要求继续履行合同、支付赔偿金或要求用人单位支付违法解除劳动合同的赔偿金（通常为经济补偿金的两倍）。
三、建议与行动
核实法律关系：
- 首先，您需要明确自己与中介、用人单位之间的法律关系，以便确定适用的法律条款和救济途径。
审查合同条款：
- 仔细审查您与中介或用人单位签订的合同条款，了解双方的权利义务和离职程序。
收集证据：
- 若您认为中介或用人单位的行为构成违法解除劳动合同，应收集相关证据（如劳动合同、工资单、离职通知等）以支持您的主张。
寻求法律救济：
- 根据具体情况，您可以向当地劳动监察部门投诉、申请劳动仲裁或提起诉讼等途径维护自己的合法权益。
最后，由于劳动纠纷涉及的法律条款和程序较为复杂，且每个案件的具体情况都有所不同，因此我建议您在处理此类问题时务必谨慎行事。如果您有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。