针对您提出的“用工单位派遣的员工实行综合工时制，用工单位是否要申请综合工时审批”的问题，以下是我的详细解答：
用工单位派遣的员工实行综合工时制，确实需要由用工单位来申请综合工时审批。这一要求主要基于以下几点原因和依据：
审批管理的必要性：
- 根据《关于企业实行不定时工作制和综合计算工时工作制的审批管理办法》及相关规定，企业部分岗位因生产特点或工作性质不能实行标准工时制度的，需经企业申请、劳动保障行政部门批准，方可实行综合计算工时工作制。这一规定同样适用于用工单位派遣的员工。
用工单位的责任：
- 用工单位作为实际使用派遣员工的一方，对派遣员工的工作时间、工作条件等负有直接管理责任。因此，当用工单位希望派遣员工实行综合工时制时，应主动向劳动保障行政部门提出申请，并承担相应的审批手续。
审批流程与材料：
- 用工单位在申请综合工时审批时，需按照相关规定提交一系列材料，包括但不限于企业实行综合计算工时工作制申请表、申请报告、实施方案、工时管理及工资支付规章制度、职工名册及职工签名表等。这些材料旨在证明用工单位具备实行综合工时制的条件和合理性。
法律后果与合规性：
- 若用工单位未按规定申请综合工时审批而擅自实行，可能面临劳动保障行政部门的处罚，并可能引发劳动争议和纠纷。因此，从合规性和风险防控的角度出发，用工单位应严格遵守相关规定，及时申请综合工时审批。
具体操作建议：
- 了解当地政策：不同地区对于综合工时制的审批管理可能存在细微差异，用工单位应首先了解并熟悉当地的具体政策和要求。
- 准备申请材料：根据当地政策要求，准备齐全、准确的申请材料，确保申请流程的顺利进行。
- 与劳务派遣单位沟通：在申请过程中，用工单位应与劳务派遣单位保持密切沟通，确保双方对派遣员工的工作时间、工作条件等达成一致意见。
- 关注审批结果：提交申请后，用工单位应关注审批进度和结果，及时根据审批意见进行调整和完善。
综上所述，用工单位派遣的员工实行综合工时制时，确实需要由用工单位来申请综合工时审批。这一要求既符合相关法律法规的规定，也是保障派遣员工权益、维护用工单位合规运营的重要举措。