综合计算工时工作制确实需要经过劳动部门的批准。以下是对这一问题的详细解释：

一、审批的必要性

综合计算工时工作制是一种特殊的工时制度，它允许用人单位以周、月、季、年等为周期，综合计算工作时间。这种制度主要适用于因工作性质特殊、受季节及自然条件限制或生产特点需要，无法按标准工作时间衡量或需连续作业的职工。由于这种制度涉及到劳动者的工作时间和休息权益，因此，用人单位在实行前必须向劳动保障行政部门提出申请，并经过批准后方可合法实行。

二、审批程序

1. 企业申请：用人单位需要向劳动保障行政部门提交申请，说明具体工种或岗位、计算周期、休息休假办法等事项。
2. 劳动部门审批：劳动保障行政部门会对企业的申请进行审核，包括考察用人单位的实际情况、工种或岗位的特殊性、计算周期的合理性等。只有经过批准后，用人单位才能合法实行综合计算工时工作制。

三、未审批的后果

如果用人单位未经批准擅自实行综合计算工时工作制，可能会面临以下后果：

1. 劳动行政部门责令改正：劳动行政部门有权对用人单位的执行情况进行监督检查，如果发现用人单位未经批准擅自实行综合计算工时工作制，会责令其改正。
2. 罚款等处罚：根据情节轻重，劳动行政部门还可能对用人单位处以罚款等处罚。
3. 劳动者权益受损：未经批准的综合计算工时工作制可能导致劳动者的工作时间过长、休息权益得不到保障，从而损害劳动者的合法权益。

四、法律建议

1. 用人单位应严格遵守审批程序：在实行综合计算工时工作制前，务必向劳动保障行政部门提出申请，并经过批准后方可实行。
2. 合理安排工作与休息：用人单位应确保劳动者在综合计算周期内有适当的休息时间，并依法支付加班费等费用。
3. 劳动者应了解自身权益：劳动者有权了解用人单位是否实行了合法的综合计算工时工作制，并有权要求用人单位提供相关的审批文件和休息休假安排。如果劳动者的权益受到侵害，可以通过劳动仲裁等途径维护自身合法权益。

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