结论前置：公司因员工开车致车子损坏罚扣员工是否合理，需根据具体情况判断，主要看员工是否存在故意或重大过失，以及公司规章制度是否合法合理。以下从不同角度进行分析：
一、员工责任角度
故意或重大过失：
- 如果员工在驾驶过程中存在故意损坏车辆的行为，如恶意撞击、违规操作导致车辆严重损坏等，那么员工应当承担相应的赔偿责任。此时，公司根据规章制度对员工进行罚扣，从法律和情理上都是合理的。
- 如果员工因重大过失导致车辆损坏，如严重违反交通规则、未按照操作规程驾驶等，且这种过失与车辆损坏之间存在直接的因果关系，那么员工也应当承担一定的赔偿责任。公司在此情况下对员工进行罚扣，同样具有合理性。
一般过失或无过失：
- 如果员工在驾驶过程中仅存在一般过失，如轻微违规、操作不当等，且这种过失并未直接导致车辆损坏，或者损坏程度较轻，那么员工可能不需要承担全部赔偿责任。此时，公司如果过度罚扣员工，可能缺乏合理性。
- 如果员工在驾驶过程中无过失，如因第三方原因导致车辆损坏，那么员工不应当承担赔偿责任。公司在此情况下罚扣员工，显然是不合理的。
二、公司规章制度角度
规章制度合法性：
- 公司对员工进行罚扣的依据是其内部的规章制度。如果这些规章制度是依法制定的，且内容合法、合理，那么公司有权根据规章制度对员工进行罚扣。
- 如果公司的规章制度存在违法或不合理之处，如罚扣金额过高、罚扣条件过于苛刻等，那么这些规章制度可能无效，公司据此对员工进行罚扣也缺乏合法性。
规章制度执行程序：
- 公司在执行罚扣时，应当遵循一定的程序，如事先告知员工、听取员工陈述和申辩、提供证据等。如果公司未按照程序执行罚扣，可能损害员工的合法权益。
三、法律建议
对于员工：
- 如果认为公司的罚扣不合理，可以与公司进行沟通协商，要求公司提供罚扣的依据和证据。
- 如果沟通无果，可以向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，维护自己的合法权益。
对于公司：
- 应当制定合法、合理的规章制度，并明确罚扣的条件和程序。
- 在执行罚扣时，应当遵循程序公正、证据充分的原则，避免损害员工的合法权益。
举例说明：假设某公司员工在驾驶公司车辆时，因严重违反交通规则导致车辆严重损坏。公司根据规章制度对员工进行了罚扣。在此情况下，如果公司的规章制度合法合理，且员工确实存在严重过失，那么公司的罚扣行为是合理的。反之，如果员工仅存在轻微过失或无过失，或者公司的规章制度存在违法或不合理之处，那么公司的罚扣行为可能缺乏合理性。
进一步思考：在实际操作中，公司罚扣员工往往涉及复杂的法律关系和事实认定。因此，在处理此类纠纷时，建议双方保持冷静、理性沟通，并寻求专业法律人士的帮助，以维护各自的合法权益。如果你有具体的法律问题或需要进一步的法律建议，可以直接向我咨询。